Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDG4

SCRN3, Secernin-3, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCRN3Q0VDG4 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCRN3Q0VDG4 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
SCRN3Q0VDG4 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SCRN3Q0VDG4 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SCRN3Q0VDG4 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SCRN3Q0VDG4 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SCRN3Q0VDG4 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SCRN3Q0VDG4 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
SCRN3Q0VDG4 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCRN3Q0VDG4 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCRN3Q0VDG4 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCRN3Q0VDG4 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SCRN3Q0VDG4 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCRN3Q0VDG4 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SCRN3Q0VDG4 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCRN3Q0VDG4 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SCRN3Q0VDG4 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCRN3Q0VDG4 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
SCRN3Q0VDG4 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCRN3Q0VDG4 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCRN3Q0VDG4 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SCRN3Q0VDG4 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCRN3Q0VDG4 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCRN3Q0VDG4 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCRN3Q0VDG4 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCRN3Q0VDG4 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCRN3Q0VDG4 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCRN3Q0VDG4 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SCRN3Q0VDG4 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SCRN3Q0VDG4 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCRN3Q0VDG4 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCRN3Q0VDG4 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCRN3Q0VDG4 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCRN3Q0VDG4 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCRN3Q0VDG4 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SCRN3Q0VDG4 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCRN3Q0VDG4 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCRN3Q0VDG4 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SCRN3Q0VDG4 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCRN3Q0VDG4 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCRN3Q0VDG4 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCRN3Q0VDG4 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SCRN3Q0VDG4 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SCRN3Q0VDG4 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCRN3Q0VDG4 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCRN3Q0VDG4 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCRN3Q0VDG4 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCRN3Q0VDG4 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCRN3Q0VDG4 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCRN3Q0VDG4 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SCRN3Q0VDG4 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCRN3Q0VDG4 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCRN3Q0VDG4 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCRN3Q0VDG4 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCRN3Q0VDG4 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCRN3Q0VDG4 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCRN3Q0VDG4 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCRN3Q0VDG4 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SCRN3Q0VDG4 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.45■■□□□ 1.19
SCRN3Q0VDG4 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SCRN3Q0VDG4 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCRN3Q0VDG4 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCRN3Q0VDG4 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SCRN3Q0VDG4 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SCRN3Q0VDG4 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCRN3Q0VDG4 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCRN3Q0VDG4 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCRN3Q0VDG4 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SCRN3Q0VDG4 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
SCRN3Q0VDG4 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCRN3Q0VDG4 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCRN3Q0VDG4 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCRN3Q0VDG4 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCRN3Q0VDG4 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCRN3Q0VDG4 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCRN3Q0VDG4 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCRN3Q0VDG4 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SCRN3Q0VDG4 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCRN3Q0VDG4 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCRN3Q0VDG4 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCRN3Q0VDG4 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SCRN3Q0VDG4 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCRN3Q0VDG4 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCRN3Q0VDG4 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCRN3Q0VDG4 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCRN3Q0VDG4 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCRN3Q0VDG4 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCRN3Q0VDG4 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCRN3Q0VDG4 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCRN3Q0VDG4 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
SCRN3Q0VDG4 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCRN3Q0VDG4 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCRN3Q0VDG4 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCRN3Q0VDG4 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCRN3Q0VDG4 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCRN3Q0VDG4 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCRN3Q0VDG4 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
SCRN3Q0VDG4 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
SCRN3Q0VDG4 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SCRN3Q0VDG4 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms