Protein–RNA interactions for Protein: Q08722

CD47, Leukocyte surface antigen CD47, humanhuman

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD47Q08722 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
CD47Q08722 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CD47Q08722 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
CD47Q08722 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CD47Q08722 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CD47Q08722 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
CD47Q08722 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CD47Q08722 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CD47Q08722 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CD47Q08722 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CD47Q08722 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CD47Q08722 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CD47Q08722 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
CD47Q08722 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CD47Q08722 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CD47Q08722 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CD47Q08722 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CD47Q08722 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CD47Q08722 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CD47Q08722 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CD47Q08722 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CD47Q08722 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CD47Q08722 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CD47Q08722 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CD47Q08722 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CD47Q08722 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CD47Q08722 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CD47Q08722 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CD47Q08722 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CD47Q08722 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CD47Q08722 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CD47Q08722 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CD47Q08722 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CD47Q08722 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CD47Q08722 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CD47Q08722 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CD47Q08722 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CD47Q08722 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CD47Q08722 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CD47Q08722 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CD47Q08722 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CD47Q08722 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CD47Q08722 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CD47Q08722 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CD47Q08722 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CD47Q08722 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CD47Q08722 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CD47Q08722 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CD47Q08722 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CD47Q08722 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CD47Q08722 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CD47Q08722 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CD47Q08722 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CD47Q08722 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CD47Q08722 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CD47Q08722 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CD47Q08722 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CD47Q08722 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CD47Q08722 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CD47Q08722 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CD47Q08722 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CD47Q08722 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CD47Q08722 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CD47Q08722 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CD47Q08722 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CD47Q08722 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CD47Q08722 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CD47Q08722 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CD47Q08722 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CD47Q08722 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CD47Q08722 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CD47Q08722 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CD47Q08722 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CD47Q08722 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CD47Q08722 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CD47Q08722 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CD47Q08722 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CD47Q08722 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CD47Q08722 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CD47Q08722 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
CD47Q08722 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CD47Q08722 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CD47Q08722 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CD47Q08722 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CD47Q08722 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
CD47Q08722 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CD47Q08722 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CD47Q08722 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CD47Q08722 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CD47Q08722 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CD47Q08722 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CD47Q08722 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CD47Q08722 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CD47Q08722 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CD47Q08722 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CD47Q08722 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CD47Q08722 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CD47Q08722 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CD47Q08722 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CD47Q08722 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.9 ms