Protein–RNA interactions for Protein: Q04900

CD164, Sialomucin core protein 24, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD164Q04900 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CD164Q04900 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CD164Q04900 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CD164Q04900 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC15.02■□□□□ -0
CD164Q04900 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CD164Q04900 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CD164Q04900 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CD164Q04900 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CD164Q04900 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
CD164Q04900 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CD164Q04900 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
CD164Q04900 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CD164Q04900 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CD164Q04900 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CD164Q04900 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CD164Q04900 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CD164Q04900 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
CD164Q04900 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
CD164Q04900 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CD164Q04900 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
CD164Q04900 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
CD164Q04900 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
CD164Q04900 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CD164Q04900 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CD164Q04900 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CD164Q04900 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
CD164Q04900 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CD164Q04900 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
CD164Q04900 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CD164Q04900 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
CD164Q04900 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CD164Q04900 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CD164Q04900 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CD164Q04900 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CD164Q04900 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CD164Q04900 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CD164Q04900 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CD164Q04900 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
CD164Q04900 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CD164Q04900 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CD164Q04900 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CD164Q04900 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CD164Q04900 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CD164Q04900 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
CD164Q04900 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
CD164Q04900 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CD164Q04900 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CD164Q04900 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
CD164Q04900 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CD164Q04900 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CD164Q04900 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
CD164Q04900 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CD164Q04900 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
CD164Q04900 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CD164Q04900 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CD164Q04900 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CD164Q04900 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CD164Q04900 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CD164Q04900 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CD164Q04900 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CD164Q04900 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CD164Q04900 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CD164Q04900 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CD164Q04900 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CD164Q04900 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CD164Q04900 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CD164Q04900 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CD164Q04900 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CD164Q04900 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CD164Q04900 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CD164Q04900 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CD164Q04900 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CD164Q04900 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CD164Q04900 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CD164Q04900 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CD164Q04900 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CD164Q04900 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CD164Q04900 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CD164Q04900 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CD164Q04900 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CD164Q04900 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CD164Q04900 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CD164Q04900 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CD164Q04900 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CD164Q04900 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CD164Q04900 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CD164Q04900 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
CD164Q04900 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CD164Q04900 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
CD164Q04900 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CD164Q04900 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CD164Q04900 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CD164Q04900 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CD164Q04900 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CD164Q04900 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CD164Q04900 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CD164Q04900 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CD164Q04900 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CD164Q04900 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CD164Q04900 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.7 ms