Protein–RNA interactions for Protein: Q02338

BDH1, D-beta-hydroxybutyrate dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BDH1Q02338 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
BDH1Q02338 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
BDH1Q02338 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
BDH1Q02338 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BDH1Q02338 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
BDH1Q02338 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BDH1Q02338 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
BDH1Q02338 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BDH1Q02338 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BDH1Q02338 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
BDH1Q02338 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
BDH1Q02338 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
BDH1Q02338 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
BDH1Q02338 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
BDH1Q02338 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BDH1Q02338 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
BDH1Q02338 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BDH1Q02338 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BDH1Q02338 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
BDH1Q02338 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BDH1Q02338 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BDH1Q02338 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
BDH1Q02338 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BDH1Q02338 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
BDH1Q02338 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
BDH1Q02338 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
BDH1Q02338 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BDH1Q02338 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BDH1Q02338 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BDH1Q02338 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
BDH1Q02338 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BDH1Q02338 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BDH1Q02338 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
BDH1Q02338 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BDH1Q02338 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BDH1Q02338 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
BDH1Q02338 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BDH1Q02338 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BDH1Q02338 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BDH1Q02338 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BDH1Q02338 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
BDH1Q02338 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
BDH1Q02338 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
BDH1Q02338 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BDH1Q02338 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
BDH1Q02338 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
BDH1Q02338 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
BDH1Q02338 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.2
BDH1Q02338 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BDH1Q02338 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BDH1Q02338 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BDH1Q02338 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
BDH1Q02338 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BDH1Q02338 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
BDH1Q02338 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
BDH1Q02338 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
BDH1Q02338 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BDH1Q02338 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
BDH1Q02338 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BDH1Q02338 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BDH1Q02338 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
BDH1Q02338 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BDH1Q02338 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BDH1Q02338 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BDH1Q02338 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
BDH1Q02338 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BDH1Q02338 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BDH1Q02338 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
BDH1Q02338 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BDH1Q02338 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
BDH1Q02338 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BDH1Q02338 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BDH1Q02338 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
BDH1Q02338 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
BDH1Q02338 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BDH1Q02338 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
BDH1Q02338 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
BDH1Q02338 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
BDH1Q02338 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BDH1Q02338 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BDH1Q02338 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
BDH1Q02338 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BDH1Q02338 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BDH1Q02338 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
BDH1Q02338 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BDH1Q02338 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BDH1Q02338 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BDH1Q02338 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
BDH1Q02338 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BDH1Q02338 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BDH1Q02338 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
BDH1Q02338 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
BDH1Q02338 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BDH1Q02338 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
BDH1Q02338 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BDH1Q02338 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
BDH1Q02338 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
BDH1Q02338 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BDH1Q02338 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
BDH1Q02338 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms