Protein–RNA interactions for Protein: P78414

IRX1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX1P78414 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
IRX1P78414 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
IRX1P78414 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
IRX1P78414 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
IRX1P78414 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
IRX1P78414 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
IRX1P78414 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
IRX1P78414 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
IRX1P78414 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
IRX1P78414 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
IRX1P78414 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
IRX1P78414 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
IRX1P78414 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
IRX1P78414 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
IRX1P78414 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
IRX1P78414 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
IRX1P78414 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
IRX1P78414 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
IRX1P78414 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
IRX1P78414 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
IRX1P78414 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
IRX1P78414 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
IRX1P78414 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
IRX1P78414 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
IRX1P78414 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
IRX1P78414 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
IRX1P78414 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
IRX1P78414 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
IRX1P78414 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
IRX1P78414 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
IRX1P78414 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
IRX1P78414 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
IRX1P78414 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
IRX1P78414 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
IRX1P78414 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
IRX1P78414 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
IRX1P78414 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
IRX1P78414 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
IRX1P78414 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
IRX1P78414 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
IRX1P78414 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
IRX1P78414 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
IRX1P78414 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
IRX1P78414 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
IRX1P78414 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
IRX1P78414 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
IRX1P78414 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
IRX1P78414 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
IRX1P78414 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
IRX1P78414 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
IRX1P78414 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
IRX1P78414 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
IRX1P78414 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
IRX1P78414 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
IRX1P78414 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
IRX1P78414 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
IRX1P78414 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
IRX1P78414 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
IRX1P78414 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
IRX1P78414 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
IRX1P78414 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
IRX1P78414 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
IRX1P78414 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
IRX1P78414 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
IRX1P78414 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
IRX1P78414 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
IRX1P78414 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
IRX1P78414 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
IRX1P78414 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
IRX1P78414 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
IRX1P78414 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
IRX1P78414 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
IRX1P78414 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
IRX1P78414 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
IRX1P78414 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
IRX1P78414 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
IRX1P78414 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
IRX1P78414 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
IRX1P78414 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
IRX1P78414 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
IRX1P78414 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
IRX1P78414 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
IRX1P78414 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
IRX1P78414 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
IRX1P78414 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
IRX1P78414 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
IRX1P78414 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
IRX1P78414 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
IRX1P78414 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
IRX1P78414 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
IRX1P78414 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
IRX1P78414 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
IRX1P78414 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
IRX1P78414 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
IRX1P78414 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
IRX1P78414 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.55
IRX1P78414 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
IRX1P78414 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
IRX1P78414 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
IRX1P78414 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.1 ms