Protein–RNA interactions for Protein: P62891

RPL39, 60S ribosomal protein L39, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 51 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL39P62891 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPL39P62891 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
RPL39P62891 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPL39P62891 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPL39P62891 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPL39P62891 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPL39P62891 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPL39P62891 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPL39P62891 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
RPL39P62891 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPL39P62891 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPL39P62891 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPL39P62891 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
RPL39P62891 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPL39P62891 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPL39P62891 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
RPL39P62891 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPL39P62891 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPL39P62891 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
RPL39P62891 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
RPL39P62891 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
RPL39P62891 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RPL39P62891 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
RPL39P62891 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
RPL39P62891 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPL39P62891 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPL39P62891 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPL39P62891 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
RPL39P62891 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RPL39P62891 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
RPL39P62891 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
RPL39P62891 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPL39P62891 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
RPL39P62891 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPL39P62891 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPL39P62891 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
RPL39P62891 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPL39P62891 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPL39P62891 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
RPL39P62891 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RPL39P62891 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RPL39P62891 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RPL39P62891 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RPL39P62891 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RPL39P62891 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RPL39P62891 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RPL39P62891 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RPL39P62891 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RPL39P62891 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
RPL39P62891 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RPL39P62891 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
RPL39P62891 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RPL39P62891 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
RPL39P62891 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
RPL39P62891 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RPL39P62891 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RPL39P62891 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RPL39P62891 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
RPL39P62891 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RPL39P62891 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
RPL39P62891 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RPL39P62891 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RPL39P62891 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RPL39P62891 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
RPL39P62891 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
RPL39P62891 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RPL39P62891 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RPL39P62891 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
RPL39P62891 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RPL39P62891 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RPL39P62891 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
RPL39P62891 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RPL39P62891 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RPL39P62891 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
RPL39P62891 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RPL39P62891 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
RPL39P62891 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RPL39P62891 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RPL39P62891 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RPL39P62891 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RPL39P62891 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RPL39P62891 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RPL39P62891 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RPL39P62891 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
RPL39P62891 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
RPL39P62891 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
RPL39P62891 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RPL39P62891 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
RPL39P62891 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
RPL39P62891 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
RPL39P62891 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPL39P62891 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPL39P62891 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
RPL39P62891 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
RPL39P62891 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPL39P62891 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPL39P62891 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPL39P62891 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPL39P62891 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
RPL39P62891 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms