Protein–RNA interactions for Protein: P62837

UBE2D2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 D2, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2D2P62837 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBE2D2P62837 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
UBE2D2P62837 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBE2D2P62837 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBE2D2P62837 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
UBE2D2P62837 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBE2D2P62837 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBE2D2P62837 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBE2D2P62837 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBE2D2P62837 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
UBE2D2P62837 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
UBE2D2P62837 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
UBE2D2P62837 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
UBE2D2P62837 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
UBE2D2P62837 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
UBE2D2P62837 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
UBE2D2P62837 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
UBE2D2P62837 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
UBE2D2P62837 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBE2D2P62837 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBE2D2P62837 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBE2D2P62837 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBE2D2P62837 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBE2D2P62837 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBE2D2P62837 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBE2D2P62837 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBE2D2P62837 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBE2D2P62837 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
UBE2D2P62837 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBE2D2P62837 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
UBE2D2P62837 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBE2D2P62837 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBE2D2P62837 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
UBE2D2P62837 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBE2D2P62837 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
UBE2D2P62837 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBE2D2P62837 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBE2D2P62837 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBE2D2P62837 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
UBE2D2P62837 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBE2D2P62837 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBE2D2P62837 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBE2D2P62837 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBE2D2P62837 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBE2D2P62837 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBE2D2P62837 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBE2D2P62837 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBE2D2P62837 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
UBE2D2P62837 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBE2D2P62837 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBE2D2P62837 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
UBE2D2P62837 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
UBE2D2P62837 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
UBE2D2P62837 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
UBE2D2P62837 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBE2D2P62837 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBE2D2P62837 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBE2D2P62837 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBE2D2P62837 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBE2D2P62837 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
UBE2D2P62837 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
UBE2D2P62837 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UBE2D2P62837 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UBE2D2P62837 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UBE2D2P62837 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UBE2D2P62837 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UBE2D2P62837 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UBE2D2P62837 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBE2D2P62837 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBE2D2P62837 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBE2D2P62837 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBE2D2P62837 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBE2D2P62837 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
UBE2D2P62837 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
UBE2D2P62837 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBE2D2P62837 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBE2D2P62837 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBE2D2P62837 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBE2D2P62837 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
UBE2D2P62837 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
UBE2D2P62837 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBE2D2P62837 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBE2D2P62837 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBE2D2P62837 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBE2D2P62837 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
UBE2D2P62837 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBE2D2P62837 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBE2D2P62837 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBE2D2P62837 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
UBE2D2P62837 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
UBE2D2P62837 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
UBE2D2P62837 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
UBE2D2P62837 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
UBE2D2P62837 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
UBE2D2P62837 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
UBE2D2P62837 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
UBE2D2P62837 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
UBE2D2P62837 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
UBE2D2P62837 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
UBE2D2P62837 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.5 ms