Protein–RNA interactions for Protein: P62760

VSNL1, Visinin-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSNL1P62760 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
VSNL1P62760 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
VSNL1P62760 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
VSNL1P62760 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
VSNL1P62760 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
VSNL1P62760 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
VSNL1P62760 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
VSNL1P62760 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
VSNL1P62760 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
VSNL1P62760 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
VSNL1P62760 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
VSNL1P62760 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
VSNL1P62760 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
VSNL1P62760 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
VSNL1P62760 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
VSNL1P62760 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
VSNL1P62760 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
VSNL1P62760 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
VSNL1P62760 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
VSNL1P62760 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
VSNL1P62760 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
VSNL1P62760 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
VSNL1P62760 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
VSNL1P62760 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
VSNL1P62760 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
VSNL1P62760 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
VSNL1P62760 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
VSNL1P62760 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
VSNL1P62760 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
VSNL1P62760 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
VSNL1P62760 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
VSNL1P62760 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
VSNL1P62760 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
VSNL1P62760 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
VSNL1P62760 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
VSNL1P62760 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
VSNL1P62760 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
VSNL1P62760 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
VSNL1P62760 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
VSNL1P62760 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
VSNL1P62760 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
VSNL1P62760 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
VSNL1P62760 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
VSNL1P62760 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
VSNL1P62760 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
VSNL1P62760 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
VSNL1P62760 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
VSNL1P62760 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
VSNL1P62760 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
VSNL1P62760 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
VSNL1P62760 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
VSNL1P62760 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
VSNL1P62760 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
VSNL1P62760 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
VSNL1P62760 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
VSNL1P62760 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
VSNL1P62760 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
VSNL1P62760 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
VSNL1P62760 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
VSNL1P62760 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
VSNL1P62760 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
VSNL1P62760 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
VSNL1P62760 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
VSNL1P62760 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
VSNL1P62760 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
VSNL1P62760 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
VSNL1P62760 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
VSNL1P62760 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
VSNL1P62760 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
VSNL1P62760 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
VSNL1P62760 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
VSNL1P62760 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
VSNL1P62760 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
VSNL1P62760 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
VSNL1P62760 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
VSNL1P62760 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
VSNL1P62760 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
VSNL1P62760 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
VSNL1P62760 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
VSNL1P62760 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
VSNL1P62760 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
VSNL1P62760 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
VSNL1P62760 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
VSNL1P62760 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
VSNL1P62760 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
VSNL1P62760 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
VSNL1P62760 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
VSNL1P62760 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
VSNL1P62760 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
VSNL1P62760 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
VSNL1P62760 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
VSNL1P62760 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
VSNL1P62760 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
VSNL1P62760 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
VSNL1P62760 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
VSNL1P62760 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
VSNL1P62760 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
VSNL1P62760 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
VSNL1P62760 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
VSNL1P62760 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms