Protein–RNA interactions for Protein: P62306

SNRPF, Small nuclear ribonucleoprotein F, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPFP62306 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SNRPFP62306 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
SNRPFP62306 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SNRPFP62306 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SNRPFP62306 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
SNRPFP62306 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
SNRPFP62306 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SNRPFP62306 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SNRPFP62306 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SNRPFP62306 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SNRPFP62306 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
SNRPFP62306 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SNRPFP62306 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
SNRPFP62306 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SNRPFP62306 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.08■■■□□ 2.09
SNRPFP62306 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
SNRPFP62306 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
SNRPFP62306 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
SNRPFP62306 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SNRPFP62306 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
SNRPFP62306 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
SNRPFP62306 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
SNRPFP62306 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SNRPFP62306 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
SNRPFP62306 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SNRPFP62306 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
SNRPFP62306 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
SNRPFP62306 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SNRPFP62306 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SNRPFP62306 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
SNRPFP62306 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SNRPFP62306 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
SNRPFP62306 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SNRPFP62306 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
SNRPFP62306 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
SNRPFP62306 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SNRPFP62306 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SNRPFP62306 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SNRPFP62306 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
SNRPFP62306 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SNRPFP62306 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SNRPFP62306 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
SNRPFP62306 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SNRPFP62306 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
SNRPFP62306 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
SNRPFP62306 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
SNRPFP62306 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
SNRPFP62306 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SNRPFP62306 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SNRPFP62306 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SNRPFP62306 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SNRPFP62306 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
SNRPFP62306 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
SNRPFP62306 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
SNRPFP62306 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SNRPFP62306 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
SNRPFP62306 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
SNRPFP62306 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SNRPFP62306 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
SNRPFP62306 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
SNRPFP62306 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SNRPFP62306 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SNRPFP62306 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SNRPFP62306 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
SNRPFP62306 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SNRPFP62306 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SNRPFP62306 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SNRPFP62306 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SNRPFP62306 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SNRPFP62306 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SNRPFP62306 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SNRPFP62306 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SNRPFP62306 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
SNRPFP62306 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SNRPFP62306 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
SNRPFP62306 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SNRPFP62306 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SNRPFP62306 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SNRPFP62306 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SNRPFP62306 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SNRPFP62306 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SNRPFP62306 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
SNRPFP62306 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
SNRPFP62306 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.05
SNRPFP62306 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SNRPFP62306 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SNRPFP62306 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SNRPFP62306 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SNRPFP62306 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SNRPFP62306 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SNRPFP62306 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SNRPFP62306 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SNRPFP62306 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SNRPFP62306 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SNRPFP62306 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SNRPFP62306 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
SNRPFP62306 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SNRPFP62306 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SNRPFP62306 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
SNRPFP62306 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms