Protein–RNA interactions for Protein: P61586

RHOA, Transforming protein RhoA, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOAP61586 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RHOAP61586 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RHOAP61586 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RHOAP61586 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RHOAP61586 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RHOAP61586 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RHOAP61586 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
RHOAP61586 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
RHOAP61586 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
RHOAP61586 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
RHOAP61586 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
RHOAP61586 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
RHOAP61586 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
RHOAP61586 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
RHOAP61586 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
RHOAP61586 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
RHOAP61586 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
RHOAP61586 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RHOAP61586 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RHOAP61586 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
RHOAP61586 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
RHOAP61586 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
RHOAP61586 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RHOAP61586 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RHOAP61586 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RHOAP61586 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
RHOAP61586 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
RHOAP61586 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
RHOAP61586 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RHOAP61586 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
RHOAP61586 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
RHOAP61586 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RHOAP61586 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RHOAP61586 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RHOAP61586 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
RHOAP61586 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RHOAP61586 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
RHOAP61586 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RHOAP61586 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
RHOAP61586 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
RHOAP61586 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
RHOAP61586 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RHOAP61586 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RHOAP61586 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
RHOAP61586 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
RHOAP61586 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
RHOAP61586 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RHOAP61586 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
RHOAP61586 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
RHOAP61586 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RHOAP61586 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RHOAP61586 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
RHOAP61586 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
RHOAP61586 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RHOAP61586 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RHOAP61586 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RHOAP61586 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
RHOAP61586 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RHOAP61586 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
RHOAP61586 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RHOAP61586 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RHOAP61586 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RHOAP61586 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RHOAP61586 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
RHOAP61586 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RHOAP61586 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RHOAP61586 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RHOAP61586 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
RHOAP61586 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RHOAP61586 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RHOAP61586 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RHOAP61586 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
RHOAP61586 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
RHOAP61586 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RHOAP61586 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RHOAP61586 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
RHOAP61586 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RHOAP61586 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RHOAP61586 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RHOAP61586 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RHOAP61586 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RHOAP61586 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RHOAP61586 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RHOAP61586 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RHOAP61586 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RHOAP61586 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RHOAP61586 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
RHOAP61586 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RHOAP61586 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RHOAP61586 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RHOAP61586 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RHOAP61586 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RHOAP61586 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RHOAP61586 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RHOAP61586 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RHOAP61586 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RHOAP61586 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RHOAP61586 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RHOAP61586 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RHOAP61586 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 1320.7 ms