Protein–RNA interactions for Protein: P61224

RAP1B, Ras-related protein Rap-1b, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAP1BP61224 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAP1BP61224 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAP1BP61224 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAP1BP61224 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAP1BP61224 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAP1BP61224 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAP1BP61224 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAP1BP61224 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAP1BP61224 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAP1BP61224 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAP1BP61224 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAP1BP61224 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAP1BP61224 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAP1BP61224 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAP1BP61224 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAP1BP61224 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAP1BP61224 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAP1BP61224 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAP1BP61224 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAP1BP61224 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAP1BP61224 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAP1BP61224 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAP1BP61224 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAP1BP61224 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAP1BP61224 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAP1BP61224 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAP1BP61224 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAP1BP61224 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RAP1BP61224 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAP1BP61224 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RAP1BP61224 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAP1BP61224 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAP1BP61224 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RAP1BP61224 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAP1BP61224 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RAP1BP61224 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RAP1BP61224 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAP1BP61224 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RAP1BP61224 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
RAP1BP61224 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAP1BP61224 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAP1BP61224 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RAP1BP61224 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAP1BP61224 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAP1BP61224 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAP1BP61224 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RAP1BP61224 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAP1BP61224 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAP1BP61224 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RAP1BP61224 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
RAP1BP61224 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RAP1BP61224 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAP1BP61224 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAP1BP61224 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAP1BP61224 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAP1BP61224 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAP1BP61224 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAP1BP61224 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
RAP1BP61224 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAP1BP61224 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAP1BP61224 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAP1BP61224 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
RAP1BP61224 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAP1BP61224 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAP1BP61224 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RAP1BP61224 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
RAP1BP61224 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
RAP1BP61224 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAP1BP61224 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAP1BP61224 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAP1BP61224 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
RAP1BP61224 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
RAP1BP61224 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
RAP1BP61224 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
RAP1BP61224 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAP1BP61224 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAP1BP61224 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
RAP1BP61224 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAP1BP61224 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAP1BP61224 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
RAP1BP61224 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAP1BP61224 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RAP1BP61224 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAP1BP61224 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAP1BP61224 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAP1BP61224 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RAP1BP61224 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAP1BP61224 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAP1BP61224 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAP1BP61224 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RAP1BP61224 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAP1BP61224 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAP1BP61224 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAP1BP61224 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAP1BP61224 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RAP1BP61224 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAP1BP61224 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAP1BP61224 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAP1BP61224 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RAP1BP61224 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.9 ms