Protein–RNA interactions for Protein: P59998

ARPC4, Actin-related protein 2/3 complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARPC4P59998 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARPC4P59998 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARPC4P59998 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARPC4P59998 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ARPC4P59998 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARPC4P59998 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ARPC4P59998 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARPC4P59998 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ARPC4P59998 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARPC4P59998 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARPC4P59998 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ARPC4P59998 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARPC4P59998 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ARPC4P59998 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARPC4P59998 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARPC4P59998 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARPC4P59998 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARPC4P59998 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ARPC4P59998 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARPC4P59998 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ARPC4P59998 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
ARPC4P59998 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ARPC4P59998 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARPC4P59998 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARPC4P59998 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
ARPC4P59998 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ARPC4P59998 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ARPC4P59998 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
ARPC4P59998 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARPC4P59998 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARPC4P59998 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARPC4P59998 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARPC4P59998 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ARPC4P59998 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ARPC4P59998 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ARPC4P59998 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ARPC4P59998 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ARPC4P59998 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARPC4P59998 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARPC4P59998 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARPC4P59998 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
ARPC4P59998 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARPC4P59998 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
ARPC4P59998 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARPC4P59998 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARPC4P59998 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARPC4P59998 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARPC4P59998 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
ARPC4P59998 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARPC4P59998 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
ARPC4P59998 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
ARPC4P59998 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARPC4P59998 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARPC4P59998 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
ARPC4P59998 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARPC4P59998 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARPC4P59998 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARPC4P59998 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARPC4P59998 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
ARPC4P59998 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ARPC4P59998 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARPC4P59998 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARPC4P59998 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARPC4P59998 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARPC4P59998 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ARPC4P59998 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ARPC4P59998 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ARPC4P59998 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ARPC4P59998 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ARPC4P59998 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ARPC4P59998 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ARPC4P59998 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ARPC4P59998 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARPC4P59998 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARPC4P59998 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ARPC4P59998 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ARPC4P59998 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ARPC4P59998 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ARPC4P59998 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ARPC4P59998 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ARPC4P59998 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ARPC4P59998 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARPC4P59998 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARPC4P59998 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARPC4P59998 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARPC4P59998 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ARPC4P59998 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARPC4P59998 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARPC4P59998 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ARPC4P59998 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ARPC4P59998 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
ARPC4P59998 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ARPC4P59998 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ARPC4P59998 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARPC4P59998 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
ARPC4P59998 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARPC4P59998 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARPC4P59998 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARPC4P59998 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
ARPC4P59998 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms