Protein–RNA interactions for Protein: P58304

VSX2, Visual system homeobox 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSX2P58304 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
VSX2P58304 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
VSX2P58304 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
VSX2P58304 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
VSX2P58304 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
VSX2P58304 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
VSX2P58304 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
VSX2P58304 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
VSX2P58304 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
VSX2P58304 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
VSX2P58304 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
VSX2P58304 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VSX2P58304 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
VSX2P58304 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
VSX2P58304 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
VSX2P58304 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
VSX2P58304 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
VSX2P58304 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
VSX2P58304 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
VSX2P58304 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
VSX2P58304 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
VSX2P58304 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
VSX2P58304 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
VSX2P58304 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
VSX2P58304 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
VSX2P58304 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
VSX2P58304 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
VSX2P58304 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
VSX2P58304 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
VSX2P58304 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
VSX2P58304 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
VSX2P58304 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
VSX2P58304 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
VSX2P58304 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
VSX2P58304 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
VSX2P58304 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
VSX2P58304 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
VSX2P58304 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
VSX2P58304 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
VSX2P58304 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
VSX2P58304 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
VSX2P58304 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
VSX2P58304 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
VSX2P58304 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
VSX2P58304 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
VSX2P58304 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
VSX2P58304 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
VSX2P58304 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
VSX2P58304 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
VSX2P58304 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
VSX2P58304 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
VSX2P58304 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
VSX2P58304 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
VSX2P58304 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
VSX2P58304 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
VSX2P58304 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
VSX2P58304 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
VSX2P58304 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
VSX2P58304 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
VSX2P58304 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
VSX2P58304 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
VSX2P58304 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
VSX2P58304 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
VSX2P58304 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
VSX2P58304 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
VSX2P58304 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
VSX2P58304 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
VSX2P58304 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
VSX2P58304 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
VSX2P58304 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
VSX2P58304 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
VSX2P58304 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
VSX2P58304 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
VSX2P58304 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
VSX2P58304 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
VSX2P58304 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
VSX2P58304 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
VSX2P58304 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
VSX2P58304 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
VSX2P58304 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
VSX2P58304 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
VSX2P58304 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
VSX2P58304 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
VSX2P58304 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
VSX2P58304 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
VSX2P58304 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
VSX2P58304 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
VSX2P58304 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VSX2P58304 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VSX2P58304 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
VSX2P58304 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
VSX2P58304 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
VSX2P58304 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
VSX2P58304 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
VSX2P58304 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
VSX2P58304 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
VSX2P58304 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
VSX2P58304 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
VSX2P58304 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
VSX2P58304 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 180.4 ms