Protein–RNA interactions for Protein: P55008

AIF1, Allograft inflammatory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AIF1P55008 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
AIF1P55008 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
AIF1P55008 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
AIF1P55008 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
AIF1P55008 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
AIF1P55008 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
AIF1P55008 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
AIF1P55008 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
AIF1P55008 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
AIF1P55008 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
AIF1P55008 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
AIF1P55008 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
AIF1P55008 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
AIF1P55008 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
AIF1P55008 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
AIF1P55008 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
AIF1P55008 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
AIF1P55008 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
AIF1P55008 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
AIF1P55008 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
AIF1P55008 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
AIF1P55008 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
AIF1P55008 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
AIF1P55008 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
AIF1P55008 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
AIF1P55008 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
AIF1P55008 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
AIF1P55008 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
AIF1P55008 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
AIF1P55008 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
AIF1P55008 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
AIF1P55008 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
AIF1P55008 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
AIF1P55008 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
AIF1P55008 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
AIF1P55008 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
AIF1P55008 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
AIF1P55008 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
AIF1P55008 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
AIF1P55008 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
AIF1P55008 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
AIF1P55008 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
AIF1P55008 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
AIF1P55008 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
AIF1P55008 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
AIF1P55008 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
AIF1P55008 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
AIF1P55008 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
AIF1P55008 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
AIF1P55008 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
AIF1P55008 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
AIF1P55008 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
AIF1P55008 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
AIF1P55008 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
AIF1P55008 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
AIF1P55008 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
AIF1P55008 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
AIF1P55008 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
AIF1P55008 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
AIF1P55008 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
AIF1P55008 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
AIF1P55008 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
AIF1P55008 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
AIF1P55008 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
AIF1P55008 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
AIF1P55008 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
AIF1P55008 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
AIF1P55008 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
AIF1P55008 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
AIF1P55008 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
AIF1P55008 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
AIF1P55008 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC26.46■■□□□ 1.83
AIF1P55008 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
AIF1P55008 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.83
AIF1P55008 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
AIF1P55008 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
AIF1P55008 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
AIF1P55008 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
AIF1P55008 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
AIF1P55008 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
AIF1P55008 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
AIF1P55008 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
AIF1P55008 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
AIF1P55008 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
AIF1P55008 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
AIF1P55008 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
AIF1P55008 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.43■■□□□ 1.82
AIF1P55008 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
AIF1P55008 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
AIF1P55008 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
AIF1P55008 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
AIF1P55008 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
AIF1P55008 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
AIF1P55008 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
AIF1P55008 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
AIF1P55008 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
AIF1P55008 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
AIF1P55008 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
AIF1P55008 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
AIF1P55008 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 99.4 ms