Protein–RNA interactions for Protein: P53677

AP3M2, AP-3 complex subunit mu-2, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3M2P53677 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
AP3M2P53677 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
AP3M2P53677 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
AP3M2P53677 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
AP3M2P53677 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
AP3M2P53677 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
AP3M2P53677 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
AP3M2P53677 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
AP3M2P53677 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
AP3M2P53677 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
AP3M2P53677 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
AP3M2P53677 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
AP3M2P53677 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
AP3M2P53677 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
AP3M2P53677 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
AP3M2P53677 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
AP3M2P53677 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
AP3M2P53677 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
AP3M2P53677 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
AP3M2P53677 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
AP3M2P53677 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
AP3M2P53677 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
AP3M2P53677 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
AP3M2P53677 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
AP3M2P53677 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
AP3M2P53677 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
AP3M2P53677 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
AP3M2P53677 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
AP3M2P53677 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
AP3M2P53677 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
AP3M2P53677 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
AP3M2P53677 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
AP3M2P53677 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
AP3M2P53677 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
AP3M2P53677 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
AP3M2P53677 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
AP3M2P53677 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
AP3M2P53677 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
AP3M2P53677 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
AP3M2P53677 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
AP3M2P53677 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
AP3M2P53677 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
AP3M2P53677 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
AP3M2P53677 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
AP3M2P53677 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
AP3M2P53677 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
AP3M2P53677 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
AP3M2P53677 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
AP3M2P53677 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
AP3M2P53677 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
AP3M2P53677 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
AP3M2P53677 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
AP3M2P53677 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
AP3M2P53677 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
AP3M2P53677 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
AP3M2P53677 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
AP3M2P53677 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
AP3M2P53677 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
AP3M2P53677 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
AP3M2P53677 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
AP3M2P53677 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
AP3M2P53677 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
AP3M2P53677 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
AP3M2P53677 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
AP3M2P53677 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
AP3M2P53677 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
AP3M2P53677 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
AP3M2P53677 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
AP3M2P53677 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
AP3M2P53677 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
AP3M2P53677 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
AP3M2P53677 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
AP3M2P53677 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
AP3M2P53677 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
AP3M2P53677 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
AP3M2P53677 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
AP3M2P53677 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
AP3M2P53677 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
AP3M2P53677 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
AP3M2P53677 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
AP3M2P53677 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
AP3M2P53677 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
AP3M2P53677 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
AP3M2P53677 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
AP3M2P53677 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
AP3M2P53677 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
AP3M2P53677 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
AP3M2P53677 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.54■■■□□ 2
AP3M2P53677 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
AP3M2P53677 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
AP3M2P53677 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
AP3M2P53677 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
AP3M2P53677 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
AP3M2P53677 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
AP3M2P53677 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
AP3M2P53677 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
AP3M2P53677 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
AP3M2P53677 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
AP3M2P53677 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
AP3M2P53677 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms