Protein–RNA interactions for Protein: P50747

HLCS, Biotin--protein ligase, humanhuman

Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLCSP50747 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
HLCSP50747 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HLCSP50747 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HLCSP50747 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HLCSP50747 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
HLCSP50747 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
HLCSP50747 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
HLCSP50747 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HLCSP50747 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
HLCSP50747 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HLCSP50747 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
HLCSP50747 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
HLCSP50747 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
HLCSP50747 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
HLCSP50747 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HLCSP50747 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HLCSP50747 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
HLCSP50747 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HLCSP50747 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
HLCSP50747 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HLCSP50747 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HLCSP50747 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
HLCSP50747 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HLCSP50747 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HLCSP50747 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HLCSP50747 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HLCSP50747 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
HLCSP50747 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
HLCSP50747 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HLCSP50747 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HLCSP50747 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HLCSP50747 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HLCSP50747 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HLCSP50747 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HLCSP50747 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
HLCSP50747 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HLCSP50747 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HLCSP50747 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HLCSP50747 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HLCSP50747 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
HLCSP50747 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HLCSP50747 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HLCSP50747 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HLCSP50747 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HLCSP50747 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
HLCSP50747 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
HLCSP50747 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HLCSP50747 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
HLCSP50747 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HLCSP50747 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HLCSP50747 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
HLCSP50747 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HLCSP50747 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
HLCSP50747 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HLCSP50747 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HLCSP50747 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
HLCSP50747 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HLCSP50747 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
HLCSP50747 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HLCSP50747 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HLCSP50747 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
HLCSP50747 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
HLCSP50747 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
HLCSP50747 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HLCSP50747 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HLCSP50747 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
HLCSP50747 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
HLCSP50747 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
HLCSP50747 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
HLCSP50747 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HLCSP50747 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
HLCSP50747 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
HLCSP50747 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HLCSP50747 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HLCSP50747 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HLCSP50747 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
HLCSP50747 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
HLCSP50747 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HLCSP50747 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
HLCSP50747 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HLCSP50747 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
HLCSP50747 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HLCSP50747 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HLCSP50747 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
HLCSP50747 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HLCSP50747 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HLCSP50747 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
HLCSP50747 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
HLCSP50747 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
HLCSP50747 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
HLCSP50747 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HLCSP50747 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HLCSP50747 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HLCSP50747 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HLCSP50747 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
HLCSP50747 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
HLCSP50747 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HLCSP50747 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HLCSP50747 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
HLCSP50747 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.6 ms