Protein–RNA interactions for Protein: P49238

CX3CR1, CX3C chemokine receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CX3CR1P49238 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
CX3CR1P49238 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CX3CR1P49238 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
CX3CR1P49238 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
CX3CR1P49238 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
CX3CR1P49238 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CX3CR1P49238 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CX3CR1P49238 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CX3CR1P49238 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CX3CR1P49238 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
CX3CR1P49238 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
CX3CR1P49238 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CX3CR1P49238 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
CX3CR1P49238 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CX3CR1P49238 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
CX3CR1P49238 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
CX3CR1P49238 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CX3CR1P49238 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
CX3CR1P49238 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CX3CR1P49238 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CX3CR1P49238 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CX3CR1P49238 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CX3CR1P49238 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CX3CR1P49238 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CX3CR1P49238 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CX3CR1P49238 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CX3CR1P49238 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CX3CR1P49238 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CX3CR1P49238 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CX3CR1P49238 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CX3CR1P49238 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CX3CR1P49238 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CX3CR1P49238 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CX3CR1P49238 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CX3CR1P49238 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
CX3CR1P49238 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CX3CR1P49238 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CX3CR1P49238 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CX3CR1P49238 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CX3CR1P49238 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CX3CR1P49238 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CX3CR1P49238 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CX3CR1P49238 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CX3CR1P49238 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
CX3CR1P49238 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CX3CR1P49238 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CX3CR1P49238 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CX3CR1P49238 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CX3CR1P49238 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CX3CR1P49238 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CX3CR1P49238 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CX3CR1P49238 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CX3CR1P49238 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CX3CR1P49238 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CX3CR1P49238 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CX3CR1P49238 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CX3CR1P49238 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CX3CR1P49238 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CX3CR1P49238 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CX3CR1P49238 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CX3CR1P49238 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CX3CR1P49238 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CX3CR1P49238 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CX3CR1P49238 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CX3CR1P49238 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CX3CR1P49238 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CX3CR1P49238 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CX3CR1P49238 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CX3CR1P49238 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CX3CR1P49238 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CX3CR1P49238 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CX3CR1P49238 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CX3CR1P49238 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CX3CR1P49238 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CX3CR1P49238 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CX3CR1P49238 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CX3CR1P49238 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CX3CR1P49238 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CX3CR1P49238 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CX3CR1P49238 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CX3CR1P49238 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CX3CR1P49238 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CX3CR1P49238 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
CX3CR1P49238 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CX3CR1P49238 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CX3CR1P49238 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CX3CR1P49238 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CX3CR1P49238 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CX3CR1P49238 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CX3CR1P49238 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CX3CR1P49238 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CX3CR1P49238 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CX3CR1P49238 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CX3CR1P49238 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CX3CR1P49238 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CX3CR1P49238 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CX3CR1P49238 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CX3CR1P49238 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CX3CR1P49238 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
CX3CR1P49238 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms