Protein–RNA interactions for Protein: P49223

SPINT3, Kunitz-type protease inhibitor 3, humanhuman

Predictions only

Length 89 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPINT3P49223 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SPINT3P49223 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SPINT3P49223 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
SPINT3P49223 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
SPINT3P49223 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SPINT3P49223 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
SPINT3P49223 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
SPINT3P49223 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
SPINT3P49223 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SPINT3P49223 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
SPINT3P49223 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SPINT3P49223 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SPINT3P49223 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
SPINT3P49223 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
SPINT3P49223 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
SPINT3P49223 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SPINT3P49223 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SPINT3P49223 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
SPINT3P49223 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
SPINT3P49223 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SPINT3P49223 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SPINT3P49223 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SPINT3P49223 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SPINT3P49223 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SPINT3P49223 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SPINT3P49223 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SPINT3P49223 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
SPINT3P49223 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
SPINT3P49223 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SPINT3P49223 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
SPINT3P49223 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
SPINT3P49223 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
SPINT3P49223 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
SPINT3P49223 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
SPINT3P49223 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
SPINT3P49223 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
SPINT3P49223 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
SPINT3P49223 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
SPINT3P49223 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
SPINT3P49223 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
SPINT3P49223 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SPINT3P49223 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SPINT3P49223 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
SPINT3P49223 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
SPINT3P49223 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
SPINT3P49223 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
SPINT3P49223 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SPINT3P49223 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SPINT3P49223 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SPINT3P49223 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SPINT3P49223 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
SPINT3P49223 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
SPINT3P49223 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SPINT3P49223 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SPINT3P49223 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
SPINT3P49223 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
SPINT3P49223 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SPINT3P49223 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
SPINT3P49223 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
SPINT3P49223 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
SPINT3P49223 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
SPINT3P49223 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SPINT3P49223 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
SPINT3P49223 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
SPINT3P49223 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
SPINT3P49223 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
SPINT3P49223 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SPINT3P49223 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SPINT3P49223 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SPINT3P49223 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SPINT3P49223 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SPINT3P49223 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SPINT3P49223 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
SPINT3P49223 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.5■■□□□ 1.67
SPINT3P49223 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SPINT3P49223 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SPINT3P49223 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SPINT3P49223 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SPINT3P49223 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SPINT3P49223 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
SPINT3P49223 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
SPINT3P49223 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SPINT3P49223 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SPINT3P49223 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SPINT3P49223 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SPINT3P49223 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SPINT3P49223 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SPINT3P49223 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SPINT3P49223 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SPINT3P49223 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
SPINT3P49223 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
SPINT3P49223 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SPINT3P49223 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SPINT3P49223 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
SPINT3P49223 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
SPINT3P49223 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SPINT3P49223 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SPINT3P49223 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SPINT3P49223 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SPINT3P49223 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms