Protein–RNA interactions for Protein: P48995

TRPC1, Short transient receptor potential channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC1P48995 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRPC1P48995 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRPC1P48995 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRPC1P48995 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRPC1P48995 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRPC1P48995 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRPC1P48995 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRPC1P48995 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRPC1P48995 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRPC1P48995 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRPC1P48995 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRPC1P48995 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRPC1P48995 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRPC1P48995 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRPC1P48995 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRPC1P48995 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TRPC1P48995 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRPC1P48995 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRPC1P48995 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRPC1P48995 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRPC1P48995 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRPC1P48995 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRPC1P48995 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRPC1P48995 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRPC1P48995 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TRPC1P48995 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TRPC1P48995 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
TRPC1P48995 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRPC1P48995 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRPC1P48995 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRPC1P48995 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRPC1P48995 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TRPC1P48995 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TRPC1P48995 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRPC1P48995 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TRPC1P48995 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRPC1P48995 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRPC1P48995 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRPC1P48995 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
TRPC1P48995 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRPC1P48995 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRPC1P48995 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TRPC1P48995 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRPC1P48995 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRPC1P48995 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRPC1P48995 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRPC1P48995 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRPC1P48995 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TRPC1P48995 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRPC1P48995 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRPC1P48995 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TRPC1P48995 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRPC1P48995 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRPC1P48995 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRPC1P48995 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TRPC1P48995 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
TRPC1P48995 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
TRPC1P48995 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRPC1P48995 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRPC1P48995 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRPC1P48995 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRPC1P48995 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRPC1P48995 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRPC1P48995 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
TRPC1P48995 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRPC1P48995 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRPC1P48995 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TRPC1P48995 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRPC1P48995 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRPC1P48995 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRPC1P48995 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TRPC1P48995 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TRPC1P48995 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
TRPC1P48995 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRPC1P48995 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TRPC1P48995 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRPC1P48995 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRPC1P48995 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRPC1P48995 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRPC1P48995 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRPC1P48995 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRPC1P48995 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRPC1P48995 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRPC1P48995 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRPC1P48995 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRPC1P48995 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRPC1P48995 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRPC1P48995 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRPC1P48995 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRPC1P48995 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRPC1P48995 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRPC1P48995 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRPC1P48995 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRPC1P48995 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRPC1P48995 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRPC1P48995 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRPC1P48995 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRPC1P48995 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRPC1P48995 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRPC1P48995 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92 ms