Protein–RNA interactions for Protein: P42695

NCAPD3, Condensin-2 complex subunit D3, humanhuman

Predictions only

Length 1,498 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPD3P42695 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC46.89■■■■■ 5.1
NCAPD3P42695 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC46.89■■■■■ 5.1
NCAPD3P42695 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC46.89■■■■■ 5.1
NCAPD3P42695 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC46.88■■■■■ 5.1
NCAPD3P42695 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.88■■■■■ 5.1
NCAPD3P42695 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.87■■■■■ 5.09
NCAPD3P42695 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC46.86■■■■■ 5.09
NCAPD3P42695 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.86■■■■■ 5.09
NCAPD3P42695 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.86■■■■■ 5.09
NCAPD3P42695 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.86■■■■■ 5.09
NCAPD3P42695 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.86■■■■■ 5.09
NCAPD3P42695 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC46.85■■■■■ 5.09
NCAPD3P42695 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC46.84■■■■■ 5.09
NCAPD3P42695 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC46.83■■■■■ 5.09
NCAPD3P42695 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.83■■■■■ 5.09
NCAPD3P42695 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC46.83■■■■■ 5.09
NCAPD3P42695 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC46.82■■■■■ 5.09
NCAPD3P42695 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC46.82■■■■■ 5.09
NCAPD3P42695 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.82■■■■■ 5.09
NCAPD3P42695 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC46.81■■■■■ 5.08
NCAPD3P42695 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC46.81■■■■■ 5.08
NCAPD3P42695 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.79■■■■■ 5.08
NCAPD3P42695 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC46.78■■■■■ 5.08
NCAPD3P42695 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC46.77■■■■■ 5.08
NCAPD3P42695 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC46.77■■■■■ 5.08
NCAPD3P42695 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.76■■■■■ 5.08
NCAPD3P42695 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC46.76■■■■■ 5.08
NCAPD3P42695 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC46.76■■■■■ 5.08
NCAPD3P42695 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC46.75■■■■■ 5.08
NCAPD3P42695 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC46.75■■■■■ 5.07
NCAPD3P42695 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.75■■■■■ 5.07
NCAPD3P42695 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.74■■■■■ 5.07
NCAPD3P42695 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.73■■■■■ 5.07
NCAPD3P42695 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.73■■■■■ 5.07
NCAPD3P42695 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC46.71■■■■■ 5.07
NCAPD3P42695 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC46.7■■■■■ 5.07
NCAPD3P42695 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.7■■■■■ 5.07
NCAPD3P42695 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC46.7■■■■■ 5.07
NCAPD3P42695 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC46.7■■■■■ 5.07
NCAPD3P42695 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC46.69■■■■■ 5.06
NCAPD3P42695 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.68■■■■■ 5.06
NCAPD3P42695 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC46.67■■■■■ 5.06
NCAPD3P42695 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC46.67■■■■■ 5.06
NCAPD3P42695 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC46.66■■■■■ 5.06
NCAPD3P42695 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC46.66■■■■■ 5.06
NCAPD3P42695 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC46.65■■■■■ 5.06
NCAPD3P42695 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC46.65■■■■■ 5.06
NCAPD3P42695 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC46.65■■■■■ 5.06
NCAPD3P42695 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC46.64■■■■■ 5.06
NCAPD3P42695 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC46.63■■■■■ 5.05
NCAPD3P42695 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC46.62■■■■■ 5.05
NCAPD3P42695 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC46.62■■■■■ 5.05
NCAPD3P42695 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.62■■■■■ 5.05
NCAPD3P42695 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.61■■■■■ 5.05
NCAPD3P42695 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.61■■■■■ 5.05
NCAPD3P42695 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC46.61■■■■■ 5.05
NCAPD3P42695 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC46.61■■■■■ 5.05
NCAPD3P42695 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC46.6■■■■■ 5.05
NCAPD3P42695 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC46.59■■■■■ 5.05
NCAPD3P42695 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC46.58■■■■■ 5.05
NCAPD3P42695 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC46.58■■■■■ 5.05
NCAPD3P42695 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.58■■■■■ 5.05
NCAPD3P42695 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.57■■■■■ 5.05
NCAPD3P42695 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC46.57■■■■■ 5.05
NCAPD3P42695 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC46.57■■■■■ 5.05
NCAPD3P42695 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.57■■■■■ 5.04
NCAPD3P42695 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC46.57■■■■■ 5.04
NCAPD3P42695 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC46.57■■■■■ 5.04
NCAPD3P42695 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC46.57■■■■■ 5.04
NCAPD3P42695 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC46.56■■■■■ 5.04
NCAPD3P42695 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC46.56■■■■■ 5.04
NCAPD3P42695 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.55■■■■■ 5.04
NCAPD3P42695 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC46.54■■■■■ 5.04
NCAPD3P42695 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC46.54■■■■■ 5.04
NCAPD3P42695 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC46.52■■■■■ 5.04
NCAPD3P42695 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.52■■■■■ 5.04
NCAPD3P42695 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC46.52■■■■■ 5.04
NCAPD3P42695 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.51■■■■■ 5.04
NCAPD3P42695 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC46.51■■■■■ 5.04
NCAPD3P42695 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC46.51■■■■■ 5.04
NCAPD3P42695 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC46.5■■■■■ 5.03
NCAPD3P42695 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.49■■■■■ 5.03
NCAPD3P42695 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC46.49■■■■■ 5.03
NCAPD3P42695 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC46.48■■■■■ 5.03
NCAPD3P42695 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC46.48■■■■■ 5.03
NCAPD3P42695 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC46.47■■■■■ 5.03
NCAPD3P42695 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC46.46■■■■■ 5.03
NCAPD3P42695 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC46.46■■■■■ 5.03
NCAPD3P42695 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC46.46■■■■■ 5.03
NCAPD3P42695 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC46.44■■■■■ 5.03
NCAPD3P42695 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC46.44■■■■■ 5.02
NCAPD3P42695 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC46.44■■■■■ 5.02
NCAPD3P42695 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC46.44■■■■■ 5.02
NCAPD3P42695 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC46.44■■■■■ 5.02
NCAPD3P42695 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC46.43■■■■■ 5.02
NCAPD3P42695 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC46.43■■■■■ 5.02
NCAPD3P42695 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC46.41■■■■■ 5.02
NCAPD3P42695 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC46.41■■■■■ 5.02
NCAPD3P42695 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC46.41■■■■■ 5.02
NCAPD3P42695 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC46.4■■■■■ 5.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms