Protein–RNA interactions for Protein: P42677

RPS27, 40S ribosomal protein S27, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 84 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS27P42677 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
RPS27P42677 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
RPS27P42677 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPS27P42677 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPS27P42677 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPS27P42677 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPS27P42677 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
RPS27P42677 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPS27P42677 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPS27P42677 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPS27P42677 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPS27P42677 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPS27P42677 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPS27P42677 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
RPS27P42677 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPS27P42677 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPS27P42677 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPS27P42677 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
RPS27P42677 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPS27P42677 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
RPS27P42677 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPS27P42677 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPS27P42677 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPS27P42677 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPS27P42677 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
RPS27P42677 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
RPS27P42677 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RPS27P42677 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
RPS27P42677 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RPS27P42677 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RPS27P42677 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RPS27P42677 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RPS27P42677 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RPS27P42677 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RPS27P42677 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RPS27P42677 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
RPS27P42677 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
RPS27P42677 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPS27P42677 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
RPS27P42677 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPS27P42677 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPS27P42677 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPS27P42677 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
RPS27P42677 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPS27P42677 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPS27P42677 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPS27P42677 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPS27P42677 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPS27P42677 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPS27P42677 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
RPS27P42677 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPS27P42677 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPS27P42677 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
RPS27P42677 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPS27P42677 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPS27P42677 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
RPS27P42677 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
RPS27P42677 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
RPS27P42677 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
RPS27P42677 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RPS27P42677 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RPS27P42677 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
RPS27P42677 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPS27P42677 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPS27P42677 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPS27P42677 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPS27P42677 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPS27P42677 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPS27P42677 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPS27P42677 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
RPS27P42677 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPS27P42677 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPS27P42677 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPS27P42677 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPS27P42677 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
RPS27P42677 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
RPS27P42677 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPS27P42677 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPS27P42677 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPS27P42677 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPS27P42677 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPS27P42677 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
RPS27P42677 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPS27P42677 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
RPS27P42677 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPS27P42677 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
RPS27P42677 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPS27P42677 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPS27P42677 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
RPS27P42677 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPS27P42677 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPS27P42677 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPS27P42677 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
RPS27P42677 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
RPS27P42677 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPS27P42677 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPS27P42677 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPS27P42677 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPS27P42677 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
RPS27P42677 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms