Protein–RNA interactions for Protein: P35900

KRT20, Keratin, type I cytoskeletal 20, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT20P35900 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT20P35900 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT20P35900 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT20P35900 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT20P35900 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT20P35900 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT20P35900 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT20P35900 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT20P35900 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT20P35900 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KRT20P35900 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KRT20P35900 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KRT20P35900 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
KRT20P35900 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
KRT20P35900 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT20P35900 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT20P35900 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT20P35900 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT20P35900 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT20P35900 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT20P35900 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT20P35900 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT20P35900 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
KRT20P35900 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRT20P35900 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRT20P35900 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRT20P35900 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRT20P35900 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
KRT20P35900 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
KRT20P35900 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
KRT20P35900 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT20P35900 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT20P35900 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT20P35900 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT20P35900 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT20P35900 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT20P35900 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT20P35900 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
KRT20P35900 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT20P35900 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT20P35900 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT20P35900 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT20P35900 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
KRT20P35900 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KRT20P35900 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24■■□□□ 1.43
KRT20P35900 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
KRT20P35900 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
KRT20P35900 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
KRT20P35900 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KRT20P35900 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
KRT20P35900 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
KRT20P35900 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT20P35900 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT20P35900 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT20P35900 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT20P35900 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT20P35900 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT20P35900 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
KRT20P35900 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KRT20P35900 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
KRT20P35900 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
KRT20P35900 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
KRT20P35900 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KRT20P35900 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
KRT20P35900 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
KRT20P35900 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
KRT20P35900 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
KRT20P35900 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
KRT20P35900 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KRT20P35900 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
KRT20P35900 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KRT20P35900 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
KRT20P35900 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KRT20P35900 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
KRT20P35900 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
KRT20P35900 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
KRT20P35900 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
KRT20P35900 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
KRT20P35900 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
KRT20P35900 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
KRT20P35900 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
KRT20P35900 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
KRT20P35900 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
KRT20P35900 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
KRT20P35900 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
KRT20P35900 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KRT20P35900 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KRT20P35900 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KRT20P35900 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KRT20P35900 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KRT20P35900 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KRT20P35900 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
KRT20P35900 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
KRT20P35900 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KRT20P35900 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KRT20P35900 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KRT20P35900 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
KRT20P35900 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
KRT20P35900 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
KRT20P35900 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.8 ms