Protein–RNA interactions for Protein: P34995

PTGER1, Prostaglandin E2 receptor EP1 subtype, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGER1P34995 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PTGER1P34995 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PTGER1P34995 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
PTGER1P34995 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PTGER1P34995 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTGER1P34995 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTGER1P34995 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PTGER1P34995 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTGER1P34995 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTGER1P34995 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTGER1P34995 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTGER1P34995 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PTGER1P34995 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTGER1P34995 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PTGER1P34995 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTGER1P34995 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTGER1P34995 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTGER1P34995 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTGER1P34995 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PTGER1P34995 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTGER1P34995 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTGER1P34995 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTGER1P34995 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTGER1P34995 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PTGER1P34995 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PTGER1P34995 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PTGER1P34995 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTGER1P34995 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PTGER1P34995 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PTGER1P34995 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PTGER1P34995 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
PTGER1P34995 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PTGER1P34995 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTGER1P34995 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTGER1P34995 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PTGER1P34995 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTGER1P34995 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PTGER1P34995 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTGER1P34995 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTGER1P34995 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTGER1P34995 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PTGER1P34995 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTGER1P34995 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTGER1P34995 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTGER1P34995 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTGER1P34995 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTGER1P34995 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PTGER1P34995 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PTGER1P34995 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTGER1P34995 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTGER1P34995 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
PTGER1P34995 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTGER1P34995 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTGER1P34995 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTGER1P34995 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PTGER1P34995 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PTGER1P34995 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTGER1P34995 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTGER1P34995 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTGER1P34995 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PTGER1P34995 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTGER1P34995 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTGER1P34995 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTGER1P34995 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTGER1P34995 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PTGER1P34995 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PTGER1P34995 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PTGER1P34995 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PTGER1P34995 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTGER1P34995 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTGER1P34995 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTGER1P34995 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTGER1P34995 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PTGER1P34995 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTGER1P34995 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTGER1P34995 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTGER1P34995 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTGER1P34995 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTGER1P34995 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTGER1P34995 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTGER1P34995 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PTGER1P34995 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTGER1P34995 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTGER1P34995 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PTGER1P34995 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTGER1P34995 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTGER1P34995 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTGER1P34995 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTGER1P34995 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTGER1P34995 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
PTGER1P34995 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTGER1P34995 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTGER1P34995 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTGER1P34995 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTGER1P34995 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTGER1P34995 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
PTGER1P34995 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTGER1P34995 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTGER1P34995 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
PTGER1P34995 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87 ms