Protein–RNA interactions for Protein: P31267

HOXA6, Homeobox protein Hox-A6, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA6P31267 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HOXA6P31267 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
HOXA6P31267 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HOXA6P31267 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
HOXA6P31267 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
HOXA6P31267 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HOXA6P31267 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HOXA6P31267 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HOXA6P31267 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
HOXA6P31267 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
HOXA6P31267 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
HOXA6P31267 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HOXA6P31267 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
HOXA6P31267 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
HOXA6P31267 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
HOXA6P31267 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
HOXA6P31267 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
HOXA6P31267 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
HOXA6P31267 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
HOXA6P31267 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
HOXA6P31267 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
HOXA6P31267 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
HOXA6P31267 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
HOXA6P31267 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
HOXA6P31267 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
HOXA6P31267 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
HOXA6P31267 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
HOXA6P31267 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
HOXA6P31267 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
HOXA6P31267 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
HOXA6P31267 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
HOXA6P31267 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
HOXA6P31267 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
HOXA6P31267 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
HOXA6P31267 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HOXA6P31267 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HOXA6P31267 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
HOXA6P31267 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
HOXA6P31267 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
HOXA6P31267 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
HOXA6P31267 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
HOXA6P31267 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
HOXA6P31267 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
HOXA6P31267 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
HOXA6P31267 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
HOXA6P31267 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
HOXA6P31267 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
HOXA6P31267 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
HOXA6P31267 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
HOXA6P31267 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
HOXA6P31267 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
HOXA6P31267 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
HOXA6P31267 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
HOXA6P31267 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
HOXA6P31267 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
HOXA6P31267 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HOXA6P31267 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HOXA6P31267 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
HOXA6P31267 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
HOXA6P31267 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
HOXA6P31267 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
HOXA6P31267 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
HOXA6P31267 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HOXA6P31267 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
HOXA6P31267 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HOXA6P31267 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HOXA6P31267 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
HOXA6P31267 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HOXA6P31267 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HOXA6P31267 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
HOXA6P31267 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
HOXA6P31267 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
HOXA6P31267 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
HOXA6P31267 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
HOXA6P31267 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
HOXA6P31267 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HOXA6P31267 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HOXA6P31267 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
HOXA6P31267 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
HOXA6P31267 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
HOXA6P31267 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
HOXA6P31267 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HOXA6P31267 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
HOXA6P31267 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
HOXA6P31267 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HOXA6P31267 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HOXA6P31267 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
HOXA6P31267 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HOXA6P31267 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
HOXA6P31267 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
HOXA6P31267 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HOXA6P31267 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
HOXA6P31267 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HOXA6P31267 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HOXA6P31267 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HOXA6P31267 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
HOXA6P31267 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
HOXA6P31267 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HOXA6P31267 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
HOXA6P31267 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 135.6 ms