Protein–RNA interactions for Protein: P29320

EPHA3, Ephrin type-A receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 983 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA3P29320 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
EPHA3P29320 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
EPHA3P29320 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
EPHA3P29320 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
EPHA3P29320 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
EPHA3P29320 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
EPHA3P29320 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
EPHA3P29320 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
EPHA3P29320 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
EPHA3P29320 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
EPHA3P29320 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
EPHA3P29320 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
EPHA3P29320 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
EPHA3P29320 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
EPHA3P29320 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
EPHA3P29320 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
EPHA3P29320 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
EPHA3P29320 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
EPHA3P29320 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
EPHA3P29320 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
EPHA3P29320 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
EPHA3P29320 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
EPHA3P29320 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
EPHA3P29320 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EPHA3P29320 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EPHA3P29320 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EPHA3P29320 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EPHA3P29320 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
EPHA3P29320 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
EPHA3P29320 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
EPHA3P29320 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EPHA3P29320 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
EPHA3P29320 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
EPHA3P29320 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EPHA3P29320 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EPHA3P29320 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
EPHA3P29320 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EPHA3P29320 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
EPHA3P29320 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
EPHA3P29320 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
EPHA3P29320 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
EPHA3P29320 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
EPHA3P29320 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
EPHA3P29320 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
EPHA3P29320 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
EPHA3P29320 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
EPHA3P29320 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
EPHA3P29320 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
EPHA3P29320 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
EPHA3P29320 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
EPHA3P29320 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
EPHA3P29320 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
EPHA3P29320 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
EPHA3P29320 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
EPHA3P29320 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EPHA3P29320 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
EPHA3P29320 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EPHA3P29320 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
EPHA3P29320 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
EPHA3P29320 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
EPHA3P29320 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
EPHA3P29320 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
EPHA3P29320 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
EPHA3P29320 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
EPHA3P29320 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
EPHA3P29320 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
EPHA3P29320 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
EPHA3P29320 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
EPHA3P29320 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
EPHA3P29320 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
EPHA3P29320 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
EPHA3P29320 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
EPHA3P29320 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
EPHA3P29320 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
EPHA3P29320 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.75■■□□□ 1.55
EPHA3P29320 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
EPHA3P29320 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
EPHA3P29320 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
EPHA3P29320 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
EPHA3P29320 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
EPHA3P29320 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
EPHA3P29320 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
EPHA3P29320 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
EPHA3P29320 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
EPHA3P29320 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
EPHA3P29320 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
EPHA3P29320 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
EPHA3P29320 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EPHA3P29320 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.72■■□□□ 1.55
EPHA3P29320 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
EPHA3P29320 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
EPHA3P29320 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
EPHA3P29320 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
EPHA3P29320 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EPHA3P29320 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EPHA3P29320 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
EPHA3P29320 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
EPHA3P29320 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
EPHA3P29320 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
EPHA3P29320 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.5 ms