Protein–RNA interactions for Protein: P29017

CD1C, T-cell surface glycoprotein CD1c, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD1CP29017 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CD1CP29017 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CD1CP29017 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CD1CP29017 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CD1CP29017 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CD1CP29017 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CD1CP29017 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CD1CP29017 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CD1CP29017 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CD1CP29017 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CD1CP29017 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CD1CP29017 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CD1CP29017 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CD1CP29017 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CD1CP29017 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CD1CP29017 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CD1CP29017 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CD1CP29017 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CD1CP29017 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CD1CP29017 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CD1CP29017 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CD1CP29017 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CD1CP29017 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CD1CP29017 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
CD1CP29017 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CD1CP29017 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CD1CP29017 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
CD1CP29017 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CD1CP29017 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
CD1CP29017 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CD1CP29017 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
CD1CP29017 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CD1CP29017 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
CD1CP29017 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CD1CP29017 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CD1CP29017 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CD1CP29017 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
CD1CP29017 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
CD1CP29017 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
CD1CP29017 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
CD1CP29017 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CD1CP29017 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
CD1CP29017 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CD1CP29017 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
CD1CP29017 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CD1CP29017 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CD1CP29017 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
CD1CP29017 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CD1CP29017 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
CD1CP29017 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CD1CP29017 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
CD1CP29017 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
CD1CP29017 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
CD1CP29017 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CD1CP29017 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CD1CP29017 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
CD1CP29017 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
CD1CP29017 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CD1CP29017 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
CD1CP29017 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CD1CP29017 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
CD1CP29017 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
CD1CP29017 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CD1CP29017 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CD1CP29017 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CD1CP29017 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
CD1CP29017 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
CD1CP29017 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
CD1CP29017 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
CD1CP29017 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
CD1CP29017 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CD1CP29017 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CD1CP29017 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CD1CP29017 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CD1CP29017 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
CD1CP29017 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CD1CP29017 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CD1CP29017 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CD1CP29017 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CD1CP29017 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
CD1CP29017 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
CD1CP29017 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CD1CP29017 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
CD1CP29017 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CD1CP29017 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
CD1CP29017 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
CD1CP29017 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CD1CP29017 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CD1CP29017 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CD1CP29017 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
CD1CP29017 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CD1CP29017 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CD1CP29017 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
CD1CP29017 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
CD1CP29017 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CD1CP29017 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CD1CP29017 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CD1CP29017 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
CD1CP29017 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
CD1CP29017 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms