Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
POLR2AP24928 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
POLR2AP24928 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
POLR2AP24928 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC30.99■■■□□ 2.55
POLR2AP24928 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
POLR2AP24928 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC30.99■■■□□ 2.55
POLR2AP24928 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
POLR2AP24928 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
POLR2AP24928 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
POLR2AP24928 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.97■■■□□ 2.55
POLR2AP24928 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
POLR2AP24928 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
POLR2AP24928 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
POLR2AP24928 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
POLR2AP24928 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC30.96■■■□□ 2.55
POLR2AP24928 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC30.95■■■□□ 2.55
POLR2AP24928 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
POLR2AP24928 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
POLR2AP24928 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.54
POLR2AP24928 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
POLR2AP24928 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
POLR2AP24928 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
POLR2AP24928 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
POLR2AP24928 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC30.92■■■□□ 2.54
POLR2AP24928 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
POLR2AP24928 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
POLR2AP24928 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
POLR2AP24928 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC30.91■■■□□ 2.54
POLR2AP24928 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
POLR2AP24928 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
POLR2AP24928 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC30.9■■■□□ 2.54
POLR2AP24928 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
POLR2AP24928 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
POLR2AP24928 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
POLR2AP24928 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
POLR2AP24928 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
POLR2AP24928 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
POLR2AP24928 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
POLR2AP24928 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.88■■■□□ 2.53
POLR2AP24928 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
POLR2AP24928 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC30.88■■■□□ 2.53
POLR2AP24928 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.87■■■□□ 2.53
POLR2AP24928 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC30.86■■■□□ 2.53
POLR2AP24928 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
POLR2AP24928 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
POLR2AP24928 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
POLR2AP24928 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
POLR2AP24928 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC30.85■■■□□ 2.53
POLR2AP24928 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
POLR2AP24928 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
POLR2AP24928 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC30.85■■■□□ 2.53
POLR2AP24928 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
POLR2AP24928 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
POLR2AP24928 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
POLR2AP24928 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
POLR2AP24928 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC30.83■■■□□ 2.53
POLR2AP24928 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
POLR2AP24928 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
POLR2AP24928 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
POLR2AP24928 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
POLR2AP24928 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC30.81■■■□□ 2.52
POLR2AP24928 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
POLR2AP24928 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
POLR2AP24928 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
POLR2AP24928 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
POLR2AP24928 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC30.8■■■□□ 2.52
POLR2AP24928 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
POLR2AP24928 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
POLR2AP24928 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
POLR2AP24928 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
POLR2AP24928 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
POLR2AP24928 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
POLR2AP24928 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
POLR2AP24928 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
POLR2AP24928 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC30.76■■■□□ 2.51
POLR2AP24928 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC30.76■■■□□ 2.51
POLR2AP24928 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC30.76■■■□□ 2.51
POLR2AP24928 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
POLR2AP24928 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
POLR2AP24928 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC30.72■■■□□ 2.51
POLR2AP24928 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
POLR2AP24928 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
POLR2AP24928 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.51
POLR2AP24928 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.51
POLR2AP24928 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.51
POLR2AP24928 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC30.7■■■□□ 2.51
POLR2AP24928 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC30.7■■■□□ 2.5
POLR2AP24928 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
POLR2AP24928 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC30.69■■■□□ 2.5
POLR2AP24928 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC30.69■■■□□ 2.5
POLR2AP24928 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
POLR2AP24928 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC30.68■■■□□ 2.5
POLR2AP24928 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
POLR2AP24928 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC30.67■■■□□ 2.5
POLR2AP24928 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.67■■■□□ 2.5
POLR2AP24928 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC30.67■■■□□ 2.5
POLR2AP24928 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.66■■■□□ 2.5
POLR2AP24928 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
POLR2AP24928 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
POLR2AP24928 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.6 ms