Protein–RNA interactions for Protein: P23511

NFYA, Nuclear transcription factor Y subunit alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFYAP23511 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NFYAP23511 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
NFYAP23511 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NFYAP23511 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
NFYAP23511 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NFYAP23511 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NFYAP23511 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NFYAP23511 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
NFYAP23511 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
NFYAP23511 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC21.7■■□□□ 1.07
NFYAP23511 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NFYAP23511 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
NFYAP23511 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NFYAP23511 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NFYAP23511 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NFYAP23511 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NFYAP23511 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
NFYAP23511 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
NFYAP23511 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NFYAP23511 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NFYAP23511 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NFYAP23511 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
NFYAP23511 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NFYAP23511 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
NFYAP23511 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NFYAP23511 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
NFYAP23511 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NFYAP23511 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
NFYAP23511 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
NFYAP23511 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NFYAP23511 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NFYAP23511 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
NFYAP23511 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NFYAP23511 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
NFYAP23511 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NFYAP23511 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NFYAP23511 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
NFYAP23511 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
NFYAP23511 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NFYAP23511 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
NFYAP23511 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NFYAP23511 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NFYAP23511 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NFYAP23511 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NFYAP23511 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
NFYAP23511 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NFYAP23511 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
NFYAP23511 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NFYAP23511 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NFYAP23511 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
NFYAP23511 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
NFYAP23511 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
NFYAP23511 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
NFYAP23511 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
NFYAP23511 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
NFYAP23511 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
NFYAP23511 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NFYAP23511 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
NFYAP23511 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NFYAP23511 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NFYAP23511 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NFYAP23511 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
NFYAP23511 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
NFYAP23511 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NFYAP23511 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NFYAP23511 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NFYAP23511 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NFYAP23511 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NFYAP23511 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NFYAP23511 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
NFYAP23511 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
NFYAP23511 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
NFYAP23511 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NFYAP23511 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NFYAP23511 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NFYAP23511 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NFYAP23511 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
NFYAP23511 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
NFYAP23511 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NFYAP23511 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NFYAP23511 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NFYAP23511 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NFYAP23511 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NFYAP23511 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NFYAP23511 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
NFYAP23511 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
NFYAP23511 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
NFYAP23511 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NFYAP23511 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NFYAP23511 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
NFYAP23511 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
NFYAP23511 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NFYAP23511 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
NFYAP23511 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NFYAP23511 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NFYAP23511 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NFYAP23511 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
NFYAP23511 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
NFYAP23511 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
NFYAP23511 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms