Protein–RNA interactions for Protein: P22670

RFX1, MHC class II regulatory factor RFX1, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX1P22670 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RFX1P22670 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
RFX1P22670 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RFX1P22670 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RFX1P22670 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RFX1P22670 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RFX1P22670 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RFX1P22670 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RFX1P22670 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RFX1P22670 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
RFX1P22670 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
RFX1P22670 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
RFX1P22670 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
RFX1P22670 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
RFX1P22670 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
RFX1P22670 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RFX1P22670 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RFX1P22670 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RFX1P22670 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RFX1P22670 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RFX1P22670 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RFX1P22670 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
RFX1P22670 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
RFX1P22670 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
RFX1P22670 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RFX1P22670 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RFX1P22670 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RFX1P22670 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RFX1P22670 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RFX1P22670 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RFX1P22670 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RFX1P22670 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RFX1P22670 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RFX1P22670 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RFX1P22670 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RFX1P22670 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RFX1P22670 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RFX1P22670 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RFX1P22670 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
RFX1P22670 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RFX1P22670 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
RFX1P22670 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RFX1P22670 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RFX1P22670 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RFX1P22670 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RFX1P22670 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RFX1P22670 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RFX1P22670 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RFX1P22670 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RFX1P22670 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RFX1P22670 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RFX1P22670 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RFX1P22670 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RFX1P22670 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RFX1P22670 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RFX1P22670 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
RFX1P22670 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RFX1P22670 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RFX1P22670 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RFX1P22670 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RFX1P22670 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
RFX1P22670 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RFX1P22670 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
RFX1P22670 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RFX1P22670 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RFX1P22670 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.75■■■□□ 2.03
RFX1P22670 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RFX1P22670 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
RFX1P22670 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RFX1P22670 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RFX1P22670 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
RFX1P22670 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RFX1P22670 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RFX1P22670 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RFX1P22670 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RFX1P22670 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
RFX1P22670 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RFX1P22670 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RFX1P22670 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RFX1P22670 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RFX1P22670 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RFX1P22670 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RFX1P22670 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
RFX1P22670 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
RFX1P22670 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
RFX1P22670 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
RFX1P22670 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RFX1P22670 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
RFX1P22670 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RFX1P22670 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RFX1P22670 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RFX1P22670 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RFX1P22670 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RFX1P22670 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RFX1P22670 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RFX1P22670 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
RFX1P22670 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RFX1P22670 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
RFX1P22670 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
RFX1P22670 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms