Protein–RNA interactions for Protein: P19447

ERCC3, TFIIH basal transcription factor complex helicase XPB subunit, humanhuman

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC3P19447 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
ERCC3P19447 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
ERCC3P19447 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
ERCC3P19447 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC29.83■■■□□ 2.37
ERCC3P19447 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC29.83■■■□□ 2.37
ERCC3P19447 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
ERCC3P19447 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
ERCC3P19447 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
ERCC3P19447 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
ERCC3P19447 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
ERCC3P19447 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
ERCC3P19447 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
ERCC3P19447 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
ERCC3P19447 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
ERCC3P19447 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
ERCC3P19447 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
ERCC3P19447 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
ERCC3P19447 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
ERCC3P19447 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
ERCC3P19447 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
ERCC3P19447 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
ERCC3P19447 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
ERCC3P19447 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC29.76■■■□□ 2.35
ERCC3P19447 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
ERCC3P19447 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
ERCC3P19447 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
ERCC3P19447 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
ERCC3P19447 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
ERCC3P19447 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
ERCC3P19447 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
ERCC3P19447 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
ERCC3P19447 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
ERCC3P19447 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
ERCC3P19447 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
ERCC3P19447 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
ERCC3P19447 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
ERCC3P19447 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
ERCC3P19447 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
ERCC3P19447 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
ERCC3P19447 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
ERCC3P19447 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
ERCC3P19447 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
ERCC3P19447 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
ERCC3P19447 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
ERCC3P19447 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
ERCC3P19447 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
ERCC3P19447 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
ERCC3P19447 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
ERCC3P19447 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
ERCC3P19447 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.65■■■□□ 2.34
ERCC3P19447 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
ERCC3P19447 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
ERCC3P19447 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
ERCC3P19447 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
ERCC3P19447 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.64■■■□□ 2.34
ERCC3P19447 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
ERCC3P19447 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
ERCC3P19447 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
ERCC3P19447 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
ERCC3P19447 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
ERCC3P19447 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
ERCC3P19447 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
ERCC3P19447 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
ERCC3P19447 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC29.62■■■□□ 2.33
ERCC3P19447 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC29.62■■■□□ 2.33
ERCC3P19447 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
ERCC3P19447 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
ERCC3P19447 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
ERCC3P19447 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
ERCC3P19447 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
ERCC3P19447 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
ERCC3P19447 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
ERCC3P19447 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC29.59■■■□□ 2.33
ERCC3P19447 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
ERCC3P19447 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
ERCC3P19447 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
ERCC3P19447 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
ERCC3P19447 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
ERCC3P19447 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
ERCC3P19447 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
ERCC3P19447 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
ERCC3P19447 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
ERCC3P19447 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
ERCC3P19447 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
ERCC3P19447 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
ERCC3P19447 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
ERCC3P19447 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
ERCC3P19447 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
ERCC3P19447 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
ERCC3P19447 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
ERCC3P19447 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
ERCC3P19447 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
ERCC3P19447 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC29.52■■■□□ 2.32
ERCC3P19447 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
ERCC3P19447 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
ERCC3P19447 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC29.51■■■□□ 2.31
ERCC3P19447 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
ERCC3P19447 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
ERCC3P19447 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ERCC3P19447 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms