Protein–RNA interactions for Protein: P17812

CTPS1, CTP synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1P17812 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CTPS1P17812 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
CTPS1P17812 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CTPS1P17812 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CTPS1P17812 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CTPS1P17812 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CTPS1P17812 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CTPS1P17812 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CTPS1P17812 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CTPS1P17812 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CTPS1P17812 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CTPS1P17812 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CTPS1P17812 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CTPS1P17812 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
CTPS1P17812 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
CTPS1P17812 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
CTPS1P17812 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CTPS1P17812 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CTPS1P17812 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CTPS1P17812 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CTPS1P17812 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CTPS1P17812 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
CTPS1P17812 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CTPS1P17812 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CTPS1P17812 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CTPS1P17812 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CTPS1P17812 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CTPS1P17812 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CTPS1P17812 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CTPS1P17812 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CTPS1P17812 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CTPS1P17812 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CTPS1P17812 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CTPS1P17812 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CTPS1P17812 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CTPS1P17812 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CTPS1P17812 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CTPS1P17812 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CTPS1P17812 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CTPS1P17812 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CTPS1P17812 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CTPS1P17812 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CTPS1P17812 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CTPS1P17812 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CTPS1P17812 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CTPS1P17812 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CTPS1P17812 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CTPS1P17812 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CTPS1P17812 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CTPS1P17812 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CTPS1P17812 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CTPS1P17812 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CTPS1P17812 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CTPS1P17812 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CTPS1P17812 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CTPS1P17812 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CTPS1P17812 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CTPS1P17812 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CTPS1P17812 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CTPS1P17812 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CTPS1P17812 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CTPS1P17812 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CTPS1P17812 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CTPS1P17812 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CTPS1P17812 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CTPS1P17812 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CTPS1P17812 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CTPS1P17812 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CTPS1P17812 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CTPS1P17812 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CTPS1P17812 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CTPS1P17812 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CTPS1P17812 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CTPS1P17812 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CTPS1P17812 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CTPS1P17812 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CTPS1P17812 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CTPS1P17812 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CTPS1P17812 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CTPS1P17812 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CTPS1P17812 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CTPS1P17812 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CTPS1P17812 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CTPS1P17812 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CTPS1P17812 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CTPS1P17812 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CTPS1P17812 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CTPS1P17812 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CTPS1P17812 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CTPS1P17812 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CTPS1P17812 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CTPS1P17812 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CTPS1P17812 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CTPS1P17812 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CTPS1P17812 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CTPS1P17812 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
CTPS1P17812 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
CTPS1P17812 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CTPS1P17812 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CTPS1P17812 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.6 ms