Protein–RNA interactions for Protein: P17661

DES, Desmin, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DESP17661 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
DESP17661 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
DESP17661 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
DESP17661 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
DESP17661 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
DESP17661 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
DESP17661 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
DESP17661 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
DESP17661 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
DESP17661 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
DESP17661 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
DESP17661 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
DESP17661 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
DESP17661 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
DESP17661 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
DESP17661 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
DESP17661 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
DESP17661 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
DESP17661 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
DESP17661 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
DESP17661 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
DESP17661 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
DESP17661 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.82■■□□□ 1.88
DESP17661 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
DESP17661 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
DESP17661 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
DESP17661 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
DESP17661 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
DESP17661 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
DESP17661 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
DESP17661 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
DESP17661 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
DESP17661 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
DESP17661 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
DESP17661 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
DESP17661 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
DESP17661 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
DESP17661 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
DESP17661 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
DESP17661 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
DESP17661 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
DESP17661 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
DESP17661 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
DESP17661 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
DESP17661 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
DESP17661 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
DESP17661 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
DESP17661 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
DESP17661 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26.78■■□□□ 1.88
DESP17661 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
DESP17661 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
DESP17661 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
DESP17661 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
DESP17661 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
DESP17661 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
DESP17661 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
DESP17661 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
DESP17661 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
DESP17661 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
DESP17661 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
DESP17661 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
DESP17661 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
DESP17661 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
DESP17661 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
DESP17661 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
DESP17661 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
DESP17661 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
DESP17661 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
DESP17661 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
DESP17661 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
DESP17661 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
DESP17661 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
DESP17661 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
DESP17661 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
DESP17661 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
DESP17661 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
DESP17661 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
DESP17661 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
DESP17661 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
DESP17661 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
DESP17661 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
DESP17661 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
DESP17661 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
DESP17661 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
DESP17661 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
DESP17661 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.69■■□□□ 1.86
DESP17661 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
DESP17661 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
DESP17661 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
DESP17661 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
DESP17661 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
DESP17661 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
DESP17661 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
DESP17661 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
DESP17661 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
DESP17661 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
DESP17661 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
DESP17661 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
DESP17661 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
DESP17661 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms