Protein–RNA interactions for Protein: P17035

ZNF28, Zinc finger protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF28P17035 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF28P17035 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF28P17035 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ZNF28P17035 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF28P17035 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
ZNF28P17035 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF28P17035 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ZNF28P17035 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF28P17035 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF28P17035 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ZNF28P17035 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNF28P17035 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNF28P17035 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNF28P17035 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ZNF28P17035 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF28P17035 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF28P17035 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF28P17035 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ZNF28P17035 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF28P17035 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF28P17035 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ZNF28P17035 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF28P17035 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF28P17035 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ZNF28P17035 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF28P17035 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF28P17035 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF28P17035 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF28P17035 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ZNF28P17035 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF28P17035 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF28P17035 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF28P17035 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF28P17035 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ZNF28P17035 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
ZNF28P17035 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ZNF28P17035 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ZNF28P17035 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF28P17035 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF28P17035 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF28P17035 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF28P17035 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ZNF28P17035 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF28P17035 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ZNF28P17035 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF28P17035 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF28P17035 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF28P17035 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ZNF28P17035 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF28P17035 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF28P17035 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF28P17035 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF28P17035 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ZNF28P17035 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNF28P17035 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNF28P17035 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNF28P17035 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNF28P17035 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ZNF28P17035 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF28P17035 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF28P17035 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ZNF28P17035 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF28P17035 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF28P17035 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF28P17035 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF28P17035 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ZNF28P17035 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ZNF28P17035 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF28P17035 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF28P17035 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF28P17035 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF28P17035 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF28P17035 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF28P17035 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF28P17035 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF28P17035 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF28P17035 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF28P17035 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF28P17035 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF28P17035 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF28P17035 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF28P17035 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF28P17035 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF28P17035 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF28P17035 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF28P17035 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF28P17035 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF28P17035 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF28P17035 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF28P17035 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF28P17035 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF28P17035 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF28P17035 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF28P17035 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF28P17035 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF28P17035 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF28P17035 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF28P17035 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF28P17035 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF28P17035 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 217.2 ms