Protein–RNA interactions for Protein: P16615

ATP2A2, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2A2P16615 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ATP2A2P16615 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ATP2A2P16615 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ATP2A2P16615 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ATP2A2P16615 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
ATP2A2P16615 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ATP2A2P16615 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ATP2A2P16615 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ATP2A2P16615 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ATP2A2P16615 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ATP2A2P16615 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ATP2A2P16615 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ATP2A2P16615 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ATP2A2P16615 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ATP2A2P16615 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ATP2A2P16615 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ATP2A2P16615 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ATP2A2P16615 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
ATP2A2P16615 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ATP2A2P16615 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ATP2A2P16615 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ATP2A2P16615 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
ATP2A2P16615 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ATP2A2P16615 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ATP2A2P16615 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ATP2A2P16615 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ATP2A2P16615 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ATP2A2P16615 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ATP2A2P16615 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
ATP2A2P16615 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ATP2A2P16615 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ATP2A2P16615 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ATP2A2P16615 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ATP2A2P16615 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
ATP2A2P16615 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
ATP2A2P16615 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ATP2A2P16615 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.26■■■□□ 2.11
ATP2A2P16615 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
ATP2A2P16615 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
ATP2A2P16615 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
ATP2A2P16615 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ATP2A2P16615 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ATP2A2P16615 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ATP2A2P16615 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
ATP2A2P16615 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
ATP2A2P16615 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
ATP2A2P16615 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
ATP2A2P16615 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
ATP2A2P16615 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ATP2A2P16615 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
ATP2A2P16615 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
ATP2A2P16615 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ATP2A2P16615 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
ATP2A2P16615 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
ATP2A2P16615 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
ATP2A2P16615 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
ATP2A2P16615 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ATP2A2P16615 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
ATP2A2P16615 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ATP2A2P16615 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
ATP2A2P16615 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ATP2A2P16615 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
ATP2A2P16615 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
ATP2A2P16615 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ATP2A2P16615 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ATP2A2P16615 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
ATP2A2P16615 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ATP2A2P16615 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
ATP2A2P16615 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ATP2A2P16615 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ATP2A2P16615 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
ATP2A2P16615 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ATP2A2P16615 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ATP2A2P16615 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ATP2A2P16615 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
ATP2A2P16615 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ATP2A2P16615 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
ATP2A2P16615 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
ATP2A2P16615 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
ATP2A2P16615 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
ATP2A2P16615 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
ATP2A2P16615 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ATP2A2P16615 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ATP2A2P16615 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ATP2A2P16615 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ATP2A2P16615 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ATP2A2P16615 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
ATP2A2P16615 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
ATP2A2P16615 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ATP2A2P16615 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
ATP2A2P16615 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ATP2A2P16615 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
ATP2A2P16615 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ATP2A2P16615 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
ATP2A2P16615 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ATP2A2P16615 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
ATP2A2P16615 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
ATP2A2P16615 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
ATP2A2P16615 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
ATP2A2P16615 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms