Protein–RNA interactions for Protein: P15428

HPGD, 15-hydroxyprostaglandin dehydrogenase [NAD(+)], humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPGDP15428 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HPGDP15428 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HPGDP15428 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
HPGDP15428 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HPGDP15428 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HPGDP15428 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HPGDP15428 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HPGDP15428 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HPGDP15428 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HPGDP15428 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HPGDP15428 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HPGDP15428 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HPGDP15428 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HPGDP15428 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HPGDP15428 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HPGDP15428 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HPGDP15428 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
HPGDP15428 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HPGDP15428 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HPGDP15428 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HPGDP15428 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HPGDP15428 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HPGDP15428 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HPGDP15428 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HPGDP15428 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HPGDP15428 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HPGDP15428 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HPGDP15428 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HPGDP15428 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HPGDP15428 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HPGDP15428 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HPGDP15428 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HPGDP15428 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
HPGDP15428 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HPGDP15428 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HPGDP15428 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HPGDP15428 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HPGDP15428 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HPGDP15428 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HPGDP15428 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HPGDP15428 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
HPGDP15428 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
HPGDP15428 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
HPGDP15428 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HPGDP15428 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HPGDP15428 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HPGDP15428 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HPGDP15428 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HPGDP15428 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HPGDP15428 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HPGDP15428 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HPGDP15428 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HPGDP15428 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HPGDP15428 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HPGDP15428 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HPGDP15428 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HPGDP15428 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HPGDP15428 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HPGDP15428 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HPGDP15428 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HPGDP15428 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HPGDP15428 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HPGDP15428 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HPGDP15428 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
HPGDP15428 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HPGDP15428 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HPGDP15428 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HPGDP15428 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
HPGDP15428 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HPGDP15428 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HPGDP15428 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HPGDP15428 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HPGDP15428 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
HPGDP15428 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HPGDP15428 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HPGDP15428 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HPGDP15428 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HPGDP15428 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HPGDP15428 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HPGDP15428 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HPGDP15428 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HPGDP15428 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HPGDP15428 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HPGDP15428 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HPGDP15428 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HPGDP15428 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HPGDP15428 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HPGDP15428 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HPGDP15428 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
HPGDP15428 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HPGDP15428 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HPGDP15428 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HPGDP15428 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HPGDP15428 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HPGDP15428 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HPGDP15428 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HPGDP15428 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HPGDP15428 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HPGDP15428 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HPGDP15428 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.4 ms