Protein–RNA interactions for Protein: P10586

PTPRF, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase F, humanhuman

Predictions only

Length 1,907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRFP10586 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
PTPRFP10586 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
PTPRFP10586 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.42
PTPRFP10586 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
PTPRFP10586 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
PTPRFP10586 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
PTPRFP10586 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
PTPRFP10586 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
PTPRFP10586 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
PTPRFP10586 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
PTPRFP10586 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
PTPRFP10586 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.13■■■□□ 2.41
PTPRFP10586 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
PTPRFP10586 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
PTPRFP10586 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
PTPRFP10586 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
PTPRFP10586 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
PTPRFP10586 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC30.11■■■□□ 2.41
PTPRFP10586 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC30.1■■■□□ 2.41
PTPRFP10586 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
PTPRFP10586 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.1■■■□□ 2.41
PTPRFP10586 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.1■■■□□ 2.41
PTPRFP10586 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
PTPRFP10586 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
PTPRFP10586 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
PTPRFP10586 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
PTPRFP10586 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
PTPRFP10586 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
PTPRFP10586 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
PTPRFP10586 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
PTPRFP10586 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC30.08■■■□□ 2.41
PTPRFP10586 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
PTPRFP10586 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
PTPRFP10586 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
PTPRFP10586 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC30.07■■■□□ 2.4
PTPRFP10586 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
PTPRFP10586 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
PTPRFP10586 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
PTPRFP10586 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
PTPRFP10586 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
PTPRFP10586 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
PTPRFP10586 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
PTPRFP10586 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
PTPRFP10586 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
PTPRFP10586 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
PTPRFP10586 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC30.04■■■□□ 2.4
PTPRFP10586 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
PTPRFP10586 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
PTPRFP10586 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
PTPRFP10586 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
PTPRFP10586 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
PTPRFP10586 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
PTPRFP10586 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
PTPRFP10586 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
PTPRFP10586 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
PTPRFP10586 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
PTPRFP10586 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
PTPRFP10586 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
PTPRFP10586 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
PTPRFP10586 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC30■■■□□ 2.39
PTPRFP10586 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
PTPRFP10586 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.98■■■□□ 2.39
PTPRFP10586 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
PTPRFP10586 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
PTPRFP10586 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
PTPRFP10586 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
PTPRFP10586 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
PTPRFP10586 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
PTPRFP10586 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PTPRFP10586 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
PTPRFP10586 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PTPRFP10586 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PTPRFP10586 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
PTPRFP10586 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
PTPRFP10586 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PTPRFP10586 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PTPRFP10586 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC29.92■■■□□ 2.38
PTPRFP10586 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
PTPRFP10586 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
PTPRFP10586 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC29.92■■■□□ 2.38
PTPRFP10586 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PTPRFP10586 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
PTPRFP10586 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PTPRFP10586 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
PTPRFP10586 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
PTPRFP10586 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
PTPRFP10586 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
PTPRFP10586 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
PTPRFP10586 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
PTPRFP10586 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC29.89■■■□□ 2.37
PTPRFP10586 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
PTPRFP10586 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
PTPRFP10586 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
PTPRFP10586 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC29.87■■■□□ 2.37
PTPRFP10586 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
PTPRFP10586 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.87■■■□□ 2.37
PTPRFP10586 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
PTPRFP10586 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.86■■■□□ 2.37
PTPRFP10586 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
PTPRFP10586 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms