Protein–RNA interactions for Protein: P0DN79

CBSL, Cystathionine beta-synthase-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBSLP0DN79 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CBSLP0DN79 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CBSLP0DN79 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CBSLP0DN79 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CBSLP0DN79 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CBSLP0DN79 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CBSLP0DN79 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CBSLP0DN79 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CBSLP0DN79 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CBSLP0DN79 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CBSLP0DN79 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CBSLP0DN79 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CBSLP0DN79 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CBSLP0DN79 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CBSLP0DN79 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CBSLP0DN79 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CBSLP0DN79 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CBSLP0DN79 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CBSLP0DN79 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CBSLP0DN79 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CBSLP0DN79 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CBSLP0DN79 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CBSLP0DN79 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CBSLP0DN79 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CBSLP0DN79 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CBSLP0DN79 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CBSLP0DN79 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CBSLP0DN79 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CBSLP0DN79 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CBSLP0DN79 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CBSLP0DN79 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CBSLP0DN79 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CBSLP0DN79 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CBSLP0DN79 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CBSLP0DN79 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CBSLP0DN79 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CBSLP0DN79 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CBSLP0DN79 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CBSLP0DN79 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CBSLP0DN79 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CBSLP0DN79 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CBSLP0DN79 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CBSLP0DN79 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CBSLP0DN79 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CBSLP0DN79 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CBSLP0DN79 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CBSLP0DN79 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CBSLP0DN79 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CBSLP0DN79 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CBSLP0DN79 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CBSLP0DN79 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CBSLP0DN79 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
CBSLP0DN79 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CBSLP0DN79 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CBSLP0DN79 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CBSLP0DN79 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CBSLP0DN79 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CBSLP0DN79 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CBSLP0DN79 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CBSLP0DN79 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CBSLP0DN79 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CBSLP0DN79 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CBSLP0DN79 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CBSLP0DN79 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CBSLP0DN79 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CBSLP0DN79 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
CBSLP0DN79 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CBSLP0DN79 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CBSLP0DN79 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CBSLP0DN79 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CBSLP0DN79 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CBSLP0DN79 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CBSLP0DN79 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CBSLP0DN79 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CBSLP0DN79 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CBSLP0DN79 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CBSLP0DN79 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CBSLP0DN79 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CBSLP0DN79 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CBSLP0DN79 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CBSLP0DN79 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CBSLP0DN79 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CBSLP0DN79 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CBSLP0DN79 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CBSLP0DN79 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CBSLP0DN79 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CBSLP0DN79 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CBSLP0DN79 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CBSLP0DN79 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CBSLP0DN79 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CBSLP0DN79 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CBSLP0DN79 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CBSLP0DN79 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CBSLP0DN79 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CBSLP0DN79 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CBSLP0DN79 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CBSLP0DN79 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CBSLP0DN79 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CBSLP0DN79 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CBSLP0DN79 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.1 ms