Protein–RNA interactions for Protein: P0DMC3

APELA, Apelin receptor early endogenous ligand, humanhuman

Predictions only

Length 54 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APELAP0DMC3 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
APELAP0DMC3 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
APELAP0DMC3 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
APELAP0DMC3 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
APELAP0DMC3 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
APELAP0DMC3 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
APELAP0DMC3 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
APELAP0DMC3 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
APELAP0DMC3 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
APELAP0DMC3 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
APELAP0DMC3 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
APELAP0DMC3 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
APELAP0DMC3 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
APELAP0DMC3 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
APELAP0DMC3 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
APELAP0DMC3 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
APELAP0DMC3 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
APELAP0DMC3 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
APELAP0DMC3 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
APELAP0DMC3 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
APELAP0DMC3 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
APELAP0DMC3 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
APELAP0DMC3 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
APELAP0DMC3 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
APELAP0DMC3 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
APELAP0DMC3 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
APELAP0DMC3 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
APELAP0DMC3 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
APELAP0DMC3 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
APELAP0DMC3 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
APELAP0DMC3 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
APELAP0DMC3 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
APELAP0DMC3 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
APELAP0DMC3 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
APELAP0DMC3 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
APELAP0DMC3 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
APELAP0DMC3 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
APELAP0DMC3 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
APELAP0DMC3 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
APELAP0DMC3 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
APELAP0DMC3 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
APELAP0DMC3 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
APELAP0DMC3 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
APELAP0DMC3 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC20.33■□□□□ 0.85
APELAP0DMC3 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
APELAP0DMC3 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
APELAP0DMC3 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
APELAP0DMC3 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
APELAP0DMC3 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
APELAP0DMC3 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
APELAP0DMC3 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
APELAP0DMC3 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
APELAP0DMC3 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
APELAP0DMC3 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
APELAP0DMC3 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
APELAP0DMC3 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
APELAP0DMC3 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
APELAP0DMC3 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
APELAP0DMC3 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
APELAP0DMC3 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
APELAP0DMC3 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
APELAP0DMC3 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
APELAP0DMC3 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
APELAP0DMC3 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
APELAP0DMC3 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
APELAP0DMC3 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
APELAP0DMC3 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
APELAP0DMC3 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
APELAP0DMC3 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
APELAP0DMC3 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
APELAP0DMC3 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
APELAP0DMC3 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
APELAP0DMC3 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
APELAP0DMC3 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
APELAP0DMC3 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
APELAP0DMC3 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
APELAP0DMC3 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
APELAP0DMC3 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
APELAP0DMC3 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
APELAP0DMC3 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
APELAP0DMC3 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
APELAP0DMC3 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
APELAP0DMC3 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
APELAP0DMC3 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
APELAP0DMC3 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
APELAP0DMC3 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
APELAP0DMC3 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
APELAP0DMC3 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
APELAP0DMC3 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
APELAP0DMC3 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
APELAP0DMC3 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
APELAP0DMC3 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
APELAP0DMC3 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
APELAP0DMC3 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
APELAP0DMC3 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
APELAP0DMC3 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
APELAP0DMC3 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
APELAP0DMC3 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
APELAP0DMC3 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
APELAP0DMC3 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms