Protein–RNA interactions for Protein: P0DKB5

TPBGL, Trophoblast glycoprotein-like, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPBGLP0DKB5 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TPBGLP0DKB5 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TPBGLP0DKB5 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
TPBGLP0DKB5 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TPBGLP0DKB5 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
TPBGLP0DKB5 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
TPBGLP0DKB5 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TPBGLP0DKB5 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TPBGLP0DKB5 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TPBGLP0DKB5 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
TPBGLP0DKB5 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TPBGLP0DKB5 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
TPBGLP0DKB5 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TPBGLP0DKB5 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
TPBGLP0DKB5 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TPBGLP0DKB5 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TPBGLP0DKB5 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TPBGLP0DKB5 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
TPBGLP0DKB5 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
TPBGLP0DKB5 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
TPBGLP0DKB5 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TPBGLP0DKB5 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TPBGLP0DKB5 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
TPBGLP0DKB5 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
TPBGLP0DKB5 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
TPBGLP0DKB5 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
TPBGLP0DKB5 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
TPBGLP0DKB5 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TPBGLP0DKB5 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
TPBGLP0DKB5 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
TPBGLP0DKB5 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TPBGLP0DKB5 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
TPBGLP0DKB5 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
TPBGLP0DKB5 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TPBGLP0DKB5 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TPBGLP0DKB5 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
TPBGLP0DKB5 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
TPBGLP0DKB5 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TPBGLP0DKB5 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TPBGLP0DKB5 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
TPBGLP0DKB5 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TPBGLP0DKB5 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
TPBGLP0DKB5 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TPBGLP0DKB5 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
TPBGLP0DKB5 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
TPBGLP0DKB5 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TPBGLP0DKB5 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
TPBGLP0DKB5 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TPBGLP0DKB5 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
TPBGLP0DKB5 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
TPBGLP0DKB5 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TPBGLP0DKB5 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
TPBGLP0DKB5 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TPBGLP0DKB5 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TPBGLP0DKB5 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TPBGLP0DKB5 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
TPBGLP0DKB5 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
TPBGLP0DKB5 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
TPBGLP0DKB5 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TPBGLP0DKB5 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
TPBGLP0DKB5 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TPBGLP0DKB5 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
TPBGLP0DKB5 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
TPBGLP0DKB5 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TPBGLP0DKB5 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TPBGLP0DKB5 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TPBGLP0DKB5 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TPBGLP0DKB5 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
TPBGLP0DKB5 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
TPBGLP0DKB5 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TPBGLP0DKB5 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
TPBGLP0DKB5 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TPBGLP0DKB5 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TPBGLP0DKB5 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
TPBGLP0DKB5 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TPBGLP0DKB5 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
TPBGLP0DKB5 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
TPBGLP0DKB5 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TPBGLP0DKB5 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
TPBGLP0DKB5 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TPBGLP0DKB5 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
TPBGLP0DKB5 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TPBGLP0DKB5 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TPBGLP0DKB5 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
TPBGLP0DKB5 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TPBGLP0DKB5 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TPBGLP0DKB5 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
TPBGLP0DKB5 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
TPBGLP0DKB5 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TPBGLP0DKB5 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
TPBGLP0DKB5 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TPBGLP0DKB5 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
TPBGLP0DKB5 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
TPBGLP0DKB5 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TPBGLP0DKB5 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
TPBGLP0DKB5 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TPBGLP0DKB5 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
TPBGLP0DKB5 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
TPBGLP0DKB5 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
TPBGLP0DKB5 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms