Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD1

RGPD2, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD2P0DJD1 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
RGPD2P0DJD1 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
RGPD2P0DJD1 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
RGPD2P0DJD1 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
RGPD2P0DJD1 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
RGPD2P0DJD1 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC34.43■■■■□ 3.1
RGPD2P0DJD1 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.41■■■■□ 3.1
RGPD2P0DJD1 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
RGPD2P0DJD1 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
RGPD2P0DJD1 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
RGPD2P0DJD1 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
RGPD2P0DJD1 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
RGPD2P0DJD1 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
RGPD2P0DJD1 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC34.39■■■■□ 3.1
RGPD2P0DJD1 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
RGPD2P0DJD1 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
RGPD2P0DJD1 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
RGPD2P0DJD1 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
RGPD2P0DJD1 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
RGPD2P0DJD1 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.38■■■■□ 3.09
RGPD2P0DJD1 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
RGPD2P0DJD1 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
RGPD2P0DJD1 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
RGPD2P0DJD1 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
RGPD2P0DJD1 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
RGPD2P0DJD1 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
RGPD2P0DJD1 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC34.36■■■■□ 3.09
RGPD2P0DJD1 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
RGPD2P0DJD1 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
RGPD2P0DJD1 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
RGPD2P0DJD1 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
RGPD2P0DJD1 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
RGPD2P0DJD1 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
RGPD2P0DJD1 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC34.33■■■■□ 3.09
RGPD2P0DJD1 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
RGPD2P0DJD1 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
RGPD2P0DJD1 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
RGPD2P0DJD1 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC34.31■■■■□ 3.08
RGPD2P0DJD1 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
RGPD2P0DJD1 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
RGPD2P0DJD1 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.31■■■■□ 3.08
RGPD2P0DJD1 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
RGPD2P0DJD1 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC34.3■■■■□ 3.08
RGPD2P0DJD1 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
RGPD2P0DJD1 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
RGPD2P0DJD1 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
RGPD2P0DJD1 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC34.28■■■■□ 3.08
RGPD2P0DJD1 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC34.28■■■■□ 3.08
RGPD2P0DJD1 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.28■■■■□ 3.08
RGPD2P0DJD1 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC34.28■■■■□ 3.08
RGPD2P0DJD1 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
RGPD2P0DJD1 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC34.28■■■■□ 3.08
RGPD2P0DJD1 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC34.28■■■■□ 3.08
RGPD2P0DJD1 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
RGPD2P0DJD1 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
RGPD2P0DJD1 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
RGPD2P0DJD1 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC34.27■■■■□ 3.08
RGPD2P0DJD1 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
RGPD2P0DJD1 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
RGPD2P0DJD1 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.07
RGPD2P0DJD1 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC34.26■■■■□ 3.07
RGPD2P0DJD1 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC34.26■■■■□ 3.07
RGPD2P0DJD1 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
RGPD2P0DJD1 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC34.25■■■■□ 3.07
RGPD2P0DJD1 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC34.25■■■■□ 3.07
RGPD2P0DJD1 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
RGPD2P0DJD1 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC34.23■■■■□ 3.07
RGPD2P0DJD1 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.23■■■■□ 3.07
RGPD2P0DJD1 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.22■■■■□ 3.07
RGPD2P0DJD1 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC34.22■■■■□ 3.07
RGPD2P0DJD1 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
RGPD2P0DJD1 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
RGPD2P0DJD1 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC34.21■■■■□ 3.07
RGPD2P0DJD1 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
RGPD2P0DJD1 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC34.2■■■■□ 3.07
RGPD2P0DJD1 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
RGPD2P0DJD1 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
RGPD2P0DJD1 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
RGPD2P0DJD1 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC34.19■■■■□ 3.06
RGPD2P0DJD1 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
RGPD2P0DJD1 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
RGPD2P0DJD1 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
RGPD2P0DJD1 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
RGPD2P0DJD1 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
RGPD2P0DJD1 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC34.18■■■■□ 3.06
RGPD2P0DJD1 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
RGPD2P0DJD1 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC34.16■■■■□ 3.06
RGPD2P0DJD1 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
RGPD2P0DJD1 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
RGPD2P0DJD1 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
RGPD2P0DJD1 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
RGPD2P0DJD1 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC34.15■■■■□ 3.06
RGPD2P0DJD1 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
RGPD2P0DJD1 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
RGPD2P0DJD1 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
RGPD2P0DJD1 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
RGPD2P0DJD1 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC34.14■■■■□ 3.06
RGPD2P0DJD1 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
RGPD2P0DJD1 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
RGPD2P0DJD1 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms