Protein–RNA interactions for Protein: P0CW27

CCDC166, Coiled-coil domain-containing protein 166, humanhuman

Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC166P0CW27 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC166P0CW27 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC166P0CW27 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC166P0CW27 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC166P0CW27 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC166P0CW27 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC166P0CW27 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC166P0CW27 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC166P0CW27 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC166P0CW27 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC166P0CW27 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC166P0CW27 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC166P0CW27 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC166P0CW27 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC166P0CW27 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC166P0CW27 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC166P0CW27 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC166P0CW27 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC166P0CW27 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC166P0CW27 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC166P0CW27 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC166P0CW27 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC166P0CW27 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC166P0CW27 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC166P0CW27 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC166P0CW27 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC166P0CW27 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC166P0CW27 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC166P0CW27 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC166P0CW27 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC166P0CW27 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC166P0CW27 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC166P0CW27 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC166P0CW27 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC166P0CW27 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC166P0CW27 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC166P0CW27 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC166P0CW27 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
CCDC166P0CW27 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC166P0CW27 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC166P0CW27 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC166P0CW27 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC166P0CW27 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC166P0CW27 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC166P0CW27 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CCDC166P0CW27 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC166P0CW27 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CCDC166P0CW27 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC166P0CW27 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC166P0CW27 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC166P0CW27 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC166P0CW27 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CCDC166P0CW27 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC166P0CW27 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC166P0CW27 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC166P0CW27 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC166P0CW27 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC166P0CW27 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CCDC166P0CW27 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC166P0CW27 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC166P0CW27 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC166P0CW27 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CCDC166P0CW27 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC166P0CW27 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC166P0CW27 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CCDC166P0CW27 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
CCDC166P0CW27 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC166P0CW27 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC166P0CW27 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC166P0CW27 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC166P0CW27 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC166P0CW27 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CCDC166P0CW27 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CCDC166P0CW27 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC166P0CW27 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC166P0CW27 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC166P0CW27 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC166P0CW27 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC166P0CW27 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC166P0CW27 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC166P0CW27 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CCDC166P0CW27 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC166P0CW27 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC166P0CW27 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC166P0CW27 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC166P0CW27 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CCDC166P0CW27 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC166P0CW27 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC166P0CW27 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CCDC166P0CW27 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC166P0CW27 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC166P0CW27 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC166P0CW27 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC166P0CW27 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC166P0CW27 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC166P0CW27 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC166P0CW27 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CCDC166P0CW27 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC166P0CW27 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CCDC166P0CW27 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77 ms