Protein–RNA interactions for Protein: P0C7V0

LINC00271, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00271, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00271P0C7V0 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
LINC00271P0C7V0 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
LINC00271P0C7V0 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
LINC00271P0C7V0 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
LINC00271P0C7V0 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
LINC00271P0C7V0 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
LINC00271P0C7V0 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
LINC00271P0C7V0 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
LINC00271P0C7V0 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
LINC00271P0C7V0 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
LINC00271P0C7V0 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.77■■■□□ 2.04
LINC00271P0C7V0 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
LINC00271P0C7V0 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
LINC00271P0C7V0 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
LINC00271P0C7V0 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
LINC00271P0C7V0 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
LINC00271P0C7V0 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
LINC00271P0C7V0 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.74■■■□□ 2.03
LINC00271P0C7V0 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
LINC00271P0C7V0 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
LINC00271P0C7V0 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LINC00271P0C7V0 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LINC00271P0C7V0 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LINC00271P0C7V0 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LINC00271P0C7V0 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LINC00271P0C7V0 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LINC00271P0C7V0 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
LINC00271P0C7V0 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
LINC00271P0C7V0 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
LINC00271P0C7V0 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.03
LINC00271P0C7V0 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
LINC00271P0C7V0 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
LINC00271P0C7V0 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LINC00271P0C7V0 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
LINC00271P0C7V0 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LINC00271P0C7V0 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
LINC00271P0C7V0 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
LINC00271P0C7V0 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
LINC00271P0C7V0 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
LINC00271P0C7V0 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LINC00271P0C7V0 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
LINC00271P0C7V0 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
LINC00271P0C7V0 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LINC00271P0C7V0 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LINC00271P0C7V0 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
LINC00271P0C7V0 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LINC00271P0C7V0 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LINC00271P0C7V0 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
LINC00271P0C7V0 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LINC00271P0C7V0 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
LINC00271P0C7V0 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
LINC00271P0C7V0 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
LINC00271P0C7V0 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
LINC00271P0C7V0 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
LINC00271P0C7V0 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LINC00271P0C7V0 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LINC00271P0C7V0 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
LINC00271P0C7V0 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LINC00271P0C7V0 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LINC00271P0C7V0 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LINC00271P0C7V0 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LINC00271P0C7V0 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LINC00271P0C7V0 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LINC00271P0C7V0 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LINC00271P0C7V0 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LINC00271P0C7V0 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LINC00271P0C7V0 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LINC00271P0C7V0 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
LINC00271P0C7V0 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
LINC00271P0C7V0 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
LINC00271P0C7V0 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
LINC00271P0C7V0 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LINC00271P0C7V0 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
LINC00271P0C7V0 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LINC00271P0C7V0 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
LINC00271P0C7V0 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.57■■■□□ 2
LINC00271P0C7V0 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.57■■■□□ 2
LINC00271P0C7V0 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LINC00271P0C7V0 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LINC00271P0C7V0 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
LINC00271P0C7V0 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LINC00271P0C7V0 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.55■■■□□ 2
LINC00271P0C7V0 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.55■■■□□ 2
LINC00271P0C7V0 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LINC00271P0C7V0 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
LINC00271P0C7V0 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
LINC00271P0C7V0 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC27.53■■■□□ 2
LINC00271P0C7V0 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.52■■■□□ 2
LINC00271P0C7V0 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
LINC00271P0C7V0 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LINC00271P0C7V0 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
LINC00271P0C7V0 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
LINC00271P0C7V0 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LINC00271P0C7V0 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
LINC00271P0C7V0 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LINC00271P0C7V0 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LINC00271P0C7V0 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
LINC00271P0C7V0 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
LINC00271P0C7V0 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
LINC00271P0C7V0 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.7 ms