Protein–RNA interactions for Protein: P0C7M6

IQCF3, IQ domain-containing protein F3, humanhuman

Predictions only

Length 154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IQCF3P0C7M6 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
IQCF3P0C7M6 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
IQCF3P0C7M6 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
IQCF3P0C7M6 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
IQCF3P0C7M6 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
IQCF3P0C7M6 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
IQCF3P0C7M6 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC28.68■■■□□ 2.18
IQCF3P0C7M6 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
IQCF3P0C7M6 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
IQCF3P0C7M6 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
IQCF3P0C7M6 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
IQCF3P0C7M6 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
IQCF3P0C7M6 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
IQCF3P0C7M6 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
IQCF3P0C7M6 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
IQCF3P0C7M6 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
IQCF3P0C7M6 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
IQCF3P0C7M6 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
IQCF3P0C7M6 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
IQCF3P0C7M6 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
IQCF3P0C7M6 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
IQCF3P0C7M6 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
IQCF3P0C7M6 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
IQCF3P0C7M6 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
IQCF3P0C7M6 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
IQCF3P0C7M6 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
IQCF3P0C7M6 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
IQCF3P0C7M6 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
IQCF3P0C7M6 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
IQCF3P0C7M6 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
IQCF3P0C7M6 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
IQCF3P0C7M6 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
IQCF3P0C7M6 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
IQCF3P0C7M6 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
IQCF3P0C7M6 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
IQCF3P0C7M6 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
IQCF3P0C7M6 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
IQCF3P0C7M6 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
IQCF3P0C7M6 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
IQCF3P0C7M6 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
IQCF3P0C7M6 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
IQCF3P0C7M6 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
IQCF3P0C7M6 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
IQCF3P0C7M6 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
IQCF3P0C7M6 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
IQCF3P0C7M6 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
IQCF3P0C7M6 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
IQCF3P0C7M6 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
IQCF3P0C7M6 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
IQCF3P0C7M6 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
IQCF3P0C7M6 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
IQCF3P0C7M6 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
IQCF3P0C7M6 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
IQCF3P0C7M6 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
IQCF3P0C7M6 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
IQCF3P0C7M6 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
IQCF3P0C7M6 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
IQCF3P0C7M6 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
IQCF3P0C7M6 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
IQCF3P0C7M6 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
IQCF3P0C7M6 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
IQCF3P0C7M6 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
IQCF3P0C7M6 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
IQCF3P0C7M6 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
IQCF3P0C7M6 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
IQCF3P0C7M6 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
IQCF3P0C7M6 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
IQCF3P0C7M6 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
IQCF3P0C7M6 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
IQCF3P0C7M6 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
IQCF3P0C7M6 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
IQCF3P0C7M6 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
IQCF3P0C7M6 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
IQCF3P0C7M6 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
IQCF3P0C7M6 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
IQCF3P0C7M6 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
IQCF3P0C7M6 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
IQCF3P0C7M6 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
IQCF3P0C7M6 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
IQCF3P0C7M6 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
IQCF3P0C7M6 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
IQCF3P0C7M6 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
IQCF3P0C7M6 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
IQCF3P0C7M6 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
IQCF3P0C7M6 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
IQCF3P0C7M6 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
IQCF3P0C7M6 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
IQCF3P0C7M6 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
IQCF3P0C7M6 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
IQCF3P0C7M6 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
IQCF3P0C7M6 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
IQCF3P0C7M6 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
IQCF3P0C7M6 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
IQCF3P0C7M6 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
IQCF3P0C7M6 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
IQCF3P0C7M6 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
IQCF3P0C7M6 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
IQCF3P0C7M6 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
IQCF3P0C7M6 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
IQCF3P0C7M6 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms