Protein–RNA interactions for Protein: P09496

CLTA, Clathrin light chain A, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTAP09496 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CLTAP09496 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CLTAP09496 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
CLTAP09496 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
CLTAP09496 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
CLTAP09496 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
CLTAP09496 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
CLTAP09496 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
CLTAP09496 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
CLTAP09496 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
CLTAP09496 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
CLTAP09496 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
CLTAP09496 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CLTAP09496 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CLTAP09496 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
CLTAP09496 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CLTAP09496 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CLTAP09496 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CLTAP09496 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CLTAP09496 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CLTAP09496 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CLTAP09496 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CLTAP09496 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CLTAP09496 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CLTAP09496 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CLTAP09496 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CLTAP09496 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28■■■□□ 2.07
CLTAP09496 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28■■■□□ 2.07
CLTAP09496 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CLTAP09496 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CLTAP09496 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CLTAP09496 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CLTAP09496 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CLTAP09496 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CLTAP09496 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CLTAP09496 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CLTAP09496 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
CLTAP09496 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CLTAP09496 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
CLTAP09496 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CLTAP09496 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CLTAP09496 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CLTAP09496 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CLTAP09496 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
CLTAP09496 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
CLTAP09496 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CLTAP09496 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CLTAP09496 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CLTAP09496 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CLTAP09496 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CLTAP09496 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CLTAP09496 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CLTAP09496 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CLTAP09496 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CLTAP09496 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
CLTAP09496 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CLTAP09496 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
CLTAP09496 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CLTAP09496 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CLTAP09496 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CLTAP09496 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CLTAP09496 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CLTAP09496 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
CLTAP09496 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CLTAP09496 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CLTAP09496 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CLTAP09496 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CLTAP09496 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CLTAP09496 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CLTAP09496 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CLTAP09496 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CLTAP09496 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CLTAP09496 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
CLTAP09496 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CLTAP09496 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CLTAP09496 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CLTAP09496 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
CLTAP09496 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CLTAP09496 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CLTAP09496 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CLTAP09496 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CLTAP09496 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CLTAP09496 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CLTAP09496 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CLTAP09496 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CLTAP09496 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CLTAP09496 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CLTAP09496 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CLTAP09496 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CLTAP09496 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CLTAP09496 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CLTAP09496 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CLTAP09496 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CLTAP09496 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CLTAP09496 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CLTAP09496 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CLTAP09496 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CLTAP09496 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CLTAP09496 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
CLTAP09496 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms