Protein–RNA interactions for Protein: P08684

CYP3A4, Cytochrome P450 3A4, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP3A4P08684 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CYP3A4P08684 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CYP3A4P08684 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
CYP3A4P08684 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CYP3A4P08684 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CYP3A4P08684 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CYP3A4P08684 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CYP3A4P08684 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CYP3A4P08684 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CYP3A4P08684 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
CYP3A4P08684 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CYP3A4P08684 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CYP3A4P08684 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CYP3A4P08684 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CYP3A4P08684 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CYP3A4P08684 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
CYP3A4P08684 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CYP3A4P08684 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CYP3A4P08684 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CYP3A4P08684 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
CYP3A4P08684 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
CYP3A4P08684 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CYP3A4P08684 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
CYP3A4P08684 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
CYP3A4P08684 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CYP3A4P08684 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
CYP3A4P08684 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
CYP3A4P08684 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
CYP3A4P08684 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CYP3A4P08684 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
CYP3A4P08684 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
CYP3A4P08684 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
CYP3A4P08684 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
CYP3A4P08684 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
CYP3A4P08684 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CYP3A4P08684 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CYP3A4P08684 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CYP3A4P08684 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CYP3A4P08684 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
CYP3A4P08684 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CYP3A4P08684 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
CYP3A4P08684 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
CYP3A4P08684 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
CYP3A4P08684 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CYP3A4P08684 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CYP3A4P08684 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CYP3A4P08684 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CYP3A4P08684 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CYP3A4P08684 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
CYP3A4P08684 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CYP3A4P08684 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
CYP3A4P08684 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
CYP3A4P08684 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
CYP3A4P08684 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CYP3A4P08684 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
CYP3A4P08684 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
CYP3A4P08684 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
CYP3A4P08684 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
CYP3A4P08684 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CYP3A4P08684 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
CYP3A4P08684 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CYP3A4P08684 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
CYP3A4P08684 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CYP3A4P08684 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CYP3A4P08684 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CYP3A4P08684 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CYP3A4P08684 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CYP3A4P08684 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CYP3A4P08684 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CYP3A4P08684 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
CYP3A4P08684 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CYP3A4P08684 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CYP3A4P08684 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CYP3A4P08684 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
CYP3A4P08684 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CYP3A4P08684 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CYP3A4P08684 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
CYP3A4P08684 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CYP3A4P08684 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CYP3A4P08684 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
CYP3A4P08684 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
CYP3A4P08684 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
CYP3A4P08684 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CYP3A4P08684 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CYP3A4P08684 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CYP3A4P08684 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CYP3A4P08684 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CYP3A4P08684 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CYP3A4P08684 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CYP3A4P08684 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CYP3A4P08684 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CYP3A4P08684 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
CYP3A4P08684 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CYP3A4P08684 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.22
CYP3A4P08684 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CYP3A4P08684 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CYP3A4P08684 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CYP3A4P08684 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CYP3A4P08684 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CYP3A4P08684 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms