Protein–RNA interactions for Protein: P08648

ITGA5, Integrin alpha-5, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA5P08648 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ITGA5P08648 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ITGA5P08648 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ITGA5P08648 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
ITGA5P08648 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ITGA5P08648 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ITGA5P08648 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
ITGA5P08648 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
ITGA5P08648 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ITGA5P08648 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ITGA5P08648 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ITGA5P08648 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ITGA5P08648 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
ITGA5P08648 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
ITGA5P08648 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ITGA5P08648 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ITGA5P08648 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ITGA5P08648 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
ITGA5P08648 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ITGA5P08648 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
ITGA5P08648 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ITGA5P08648 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
ITGA5P08648 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ITGA5P08648 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
ITGA5P08648 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
ITGA5P08648 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ITGA5P08648 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ITGA5P08648 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ITGA5P08648 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ITGA5P08648 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ITGA5P08648 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ITGA5P08648 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ITGA5P08648 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ITGA5P08648 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ITGA5P08648 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ITGA5P08648 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ITGA5P08648 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ITGA5P08648 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ITGA5P08648 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ITGA5P08648 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ITGA5P08648 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ITGA5P08648 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ITGA5P08648 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
ITGA5P08648 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ITGA5P08648 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ITGA5P08648 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ITGA5P08648 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ITGA5P08648 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ITGA5P08648 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ITGA5P08648 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
ITGA5P08648 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ITGA5P08648 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ITGA5P08648 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITGA5P08648 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITGA5P08648 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ITGA5P08648 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITGA5P08648 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITGA5P08648 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITGA5P08648 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ITGA5P08648 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ITGA5P08648 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
ITGA5P08648 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ITGA5P08648 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ITGA5P08648 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ITGA5P08648 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
ITGA5P08648 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ITGA5P08648 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ITGA5P08648 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ITGA5P08648 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ITGA5P08648 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ITGA5P08648 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ITGA5P08648 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ITGA5P08648 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ITGA5P08648 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ITGA5P08648 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ITGA5P08648 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ITGA5P08648 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ITGA5P08648 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ITGA5P08648 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
ITGA5P08648 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ITGA5P08648 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ITGA5P08648 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ITGA5P08648 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ITGA5P08648 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ITGA5P08648 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ITGA5P08648 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ITGA5P08648 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ITGA5P08648 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITGA5P08648 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITGA5P08648 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITGA5P08648 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ITGA5P08648 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ITGA5P08648 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ITGA5P08648 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
ITGA5P08648 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
ITGA5P08648 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
ITGA5P08648 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
ITGA5P08648 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITGA5P08648 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
ITGA5P08648 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms