Protein–RNA interactions for Protein: P08294

SOD3, Extracellular superoxide dismutase [Cu-Zn], humanhuman

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOD3P08294 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SOD3P08294 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SOD3P08294 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SOD3P08294 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SOD3P08294 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SOD3P08294 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SOD3P08294 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SOD3P08294 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SOD3P08294 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SOD3P08294 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SOD3P08294 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SOD3P08294 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SOD3P08294 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SOD3P08294 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SOD3P08294 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SOD3P08294 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SOD3P08294 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SOD3P08294 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SOD3P08294 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SOD3P08294 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SOD3P08294 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SOD3P08294 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SOD3P08294 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SOD3P08294 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SOD3P08294 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
SOD3P08294 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SOD3P08294 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SOD3P08294 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SOD3P08294 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
SOD3P08294 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SOD3P08294 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
SOD3P08294 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SOD3P08294 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SOD3P08294 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
SOD3P08294 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
SOD3P08294 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SOD3P08294 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SOD3P08294 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
SOD3P08294 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SOD3P08294 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
SOD3P08294 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SOD3P08294 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SOD3P08294 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
SOD3P08294 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SOD3P08294 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SOD3P08294 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SOD3P08294 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SOD3P08294 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SOD3P08294 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SOD3P08294 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SOD3P08294 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SOD3P08294 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SOD3P08294 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SOD3P08294 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SOD3P08294 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SOD3P08294 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SOD3P08294 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SOD3P08294 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SOD3P08294 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SOD3P08294 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SOD3P08294 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SOD3P08294 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
SOD3P08294 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SOD3P08294 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SOD3P08294 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SOD3P08294 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SOD3P08294 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SOD3P08294 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
SOD3P08294 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
SOD3P08294 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
SOD3P08294 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
SOD3P08294 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SOD3P08294 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SOD3P08294 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SOD3P08294 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
SOD3P08294 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SOD3P08294 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SOD3P08294 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SOD3P08294 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SOD3P08294 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SOD3P08294 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SOD3P08294 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SOD3P08294 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
SOD3P08294 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SOD3P08294 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SOD3P08294 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SOD3P08294 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SOD3P08294 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SOD3P08294 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SOD3P08294 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SOD3P08294 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SOD3P08294 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SOD3P08294 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SOD3P08294 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SOD3P08294 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SOD3P08294 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SOD3P08294 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SOD3P08294 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SOD3P08294 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SOD3P08294 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms