Protein–RNA interactions for Protein: P08238

HSP90AB1, Heat shock protein HSP 90-beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSP90AB1P08238 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
HSP90AB1P08238 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
HSP90AB1P08238 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC33.92■■■■□ 3.02
HSP90AB1P08238 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC33.92■■■■□ 3.02
HSP90AB1P08238 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
HSP90AB1P08238 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
HSP90AB1P08238 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
HSP90AB1P08238 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC33.9■■■■□ 3.02
HSP90AB1P08238 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
HSP90AB1P08238 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
HSP90AB1P08238 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
HSP90AB1P08238 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
HSP90AB1P08238 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
HSP90AB1P08238 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
HSP90AB1P08238 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
HSP90AB1P08238 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
HSP90AB1P08238 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
HSP90AB1P08238 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
HSP90AB1P08238 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.86■■■■□ 3.01
HSP90AB1P08238 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
HSP90AB1P08238 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
HSP90AB1P08238 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
HSP90AB1P08238 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
HSP90AB1P08238 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
HSP90AB1P08238 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
HSP90AB1P08238 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC33.83■■■■□ 3.01
HSP90AB1P08238 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
HSP90AB1P08238 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
HSP90AB1P08238 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
HSP90AB1P08238 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
HSP90AB1P08238 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
HSP90AB1P08238 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
HSP90AB1P08238 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
HSP90AB1P08238 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC33.8■■■■□ 3
HSP90AB1P08238 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
HSP90AB1P08238 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.79■■■■□ 3
HSP90AB1P08238 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
HSP90AB1P08238 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
HSP90AB1P08238 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
HSP90AB1P08238 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
HSP90AB1P08238 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC33.77■■■■□ 3
HSP90AB1P08238 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
HSP90AB1P08238 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.76■■■□□ 2.99
HSP90AB1P08238 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
HSP90AB1P08238 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
HSP90AB1P08238 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC33.75■■■□□ 2.99
HSP90AB1P08238 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
HSP90AB1P08238 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC33.74■■■□□ 2.99
HSP90AB1P08238 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
HSP90AB1P08238 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
HSP90AB1P08238 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
HSP90AB1P08238 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.74■■■□□ 2.99
HSP90AB1P08238 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
HSP90AB1P08238 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
HSP90AB1P08238 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
HSP90AB1P08238 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
HSP90AB1P08238 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
HSP90AB1P08238 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.73■■■□□ 2.99
HSP90AB1P08238 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC33.72■■■□□ 2.99
HSP90AB1P08238 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
HSP90AB1P08238 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC33.71■■■□□ 2.99
HSP90AB1P08238 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
HSP90AB1P08238 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
HSP90AB1P08238 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC33.71■■■□□ 2.99
HSP90AB1P08238 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC33.71■■■□□ 2.99
HSP90AB1P08238 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC33.7■■■□□ 2.99
HSP90AB1P08238 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
HSP90AB1P08238 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC33.7■■■□□ 2.99
HSP90AB1P08238 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.98
HSP90AB1P08238 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
HSP90AB1P08238 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
HSP90AB1P08238 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC33.69■■■□□ 2.98
HSP90AB1P08238 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
HSP90AB1P08238 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
HSP90AB1P08238 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC33.66■■■□□ 2.98
HSP90AB1P08238 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC33.66■■■□□ 2.98
HSP90AB1P08238 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.64■■■□□ 2.98
HSP90AB1P08238 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
HSP90AB1P08238 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
HSP90AB1P08238 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.63■■■□□ 2.97
HSP90AB1P08238 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
HSP90AB1P08238 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC33.63■■■□□ 2.97
HSP90AB1P08238 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
HSP90AB1P08238 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
HSP90AB1P08238 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
HSP90AB1P08238 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC33.61■■■□□ 2.97
HSP90AB1P08238 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
HSP90AB1P08238 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.6■■■□□ 2.97
HSP90AB1P08238 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
HSP90AB1P08238 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.59■■■□□ 2.97
HSP90AB1P08238 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
HSP90AB1P08238 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.97
HSP90AB1P08238 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC33.57■■■□□ 2.96
HSP90AB1P08238 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
HSP90AB1P08238 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
HSP90AB1P08238 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
HSP90AB1P08238 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
HSP90AB1P08238 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
HSP90AB1P08238 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC33.55■■■□□ 2.96
HSP90AB1P08238 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms