Protein–RNA interactions for Protein: P07197

NEFM, Neurofilament medium polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFMP07197 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
NEFMP07197 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
NEFMP07197 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
NEFMP07197 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
NEFMP07197 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
NEFMP07197 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
NEFMP07197 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
NEFMP07197 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC34.12■■■■□ 3.05
NEFMP07197 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
NEFMP07197 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
NEFMP07197 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC34.12■■■■□ 3.05
NEFMP07197 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.12■■■■□ 3.05
NEFMP07197 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
NEFMP07197 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
NEFMP07197 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.1■■■■□ 3.05
NEFMP07197 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
NEFMP07197 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
NEFMP07197 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
NEFMP07197 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
NEFMP07197 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
NEFMP07197 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
NEFMP07197 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.05
NEFMP07197 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
NEFMP07197 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
NEFMP07197 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
NEFMP07197 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.06■■■■□ 3.04
NEFMP07197 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC34.06■■■■□ 3.04
NEFMP07197 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
NEFMP07197 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
NEFMP07197 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
NEFMP07197 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
NEFMP07197 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
NEFMP07197 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
NEFMP07197 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
NEFMP07197 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
NEFMP07197 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
NEFMP07197 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
NEFMP07197 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.04■■■■□ 3.04
NEFMP07197 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
NEFMP07197 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
NEFMP07197 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
NEFMP07197 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC34.02■■■■□ 3.04
NEFMP07197 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
NEFMP07197 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
NEFMP07197 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
NEFMP07197 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
NEFMP07197 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC34.01■■■■□ 3.03
NEFMP07197 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
NEFMP07197 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
NEFMP07197 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC34■■■■□ 3.03
NEFMP07197 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
NEFMP07197 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
NEFMP07197 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
NEFMP07197 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
NEFMP07197 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
NEFMP07197 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC33.98■■■■□ 3.03
NEFMP07197 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC33.98■■■■□ 3.03
NEFMP07197 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
NEFMP07197 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.97■■■■□ 3.03
NEFMP07197 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC33.96■■■■□ 3.03
NEFMP07197 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
NEFMP07197 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
NEFMP07197 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
NEFMP07197 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC33.95■■■■□ 3.03
NEFMP07197 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC33.95■■■■□ 3.03
NEFMP07197 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
NEFMP07197 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
NEFMP07197 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
NEFMP07197 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC33.94■■■■□ 3.02
NEFMP07197 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
NEFMP07197 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
NEFMP07197 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
NEFMP07197 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
NEFMP07197 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
NEFMP07197 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
NEFMP07197 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
NEFMP07197 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
NEFMP07197 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
NEFMP07197 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC33.91■■■■□ 3.02
NEFMP07197 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
NEFMP07197 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
NEFMP07197 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
NEFMP07197 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
NEFMP07197 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
NEFMP07197 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
NEFMP07197 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
NEFMP07197 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
NEFMP07197 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
NEFMP07197 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
NEFMP07197 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
NEFMP07197 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
NEFMP07197 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
NEFMP07197 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC33.83■■■■□ 3.01
NEFMP07197 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
NEFMP07197 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
NEFMP07197 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC33.82■■■■□ 3
NEFMP07197 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
NEFMP07197 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC33.81■■■■□ 3
NEFMP07197 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.81■■■■□ 3
NEFMP07197 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms