Protein–RNA interactions for Protein: P04049

RAF1, RAF proto-oncogene serine/threonine-protein kinase, humanhuman

Predictions only

Length 648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAF1P04049 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAF1P04049 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAF1P04049 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAF1P04049 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
RAF1P04049 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAF1P04049 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAF1P04049 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAF1P04049 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
RAF1P04049 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAF1P04049 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAF1P04049 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAF1P04049 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAF1P04049 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAF1P04049 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAF1P04049 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAF1P04049 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
RAF1P04049 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAF1P04049 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAF1P04049 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAF1P04049 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAF1P04049 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAF1P04049 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
RAF1P04049 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23■■□□□ 1.27
RAF1P04049 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
RAF1P04049 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
RAF1P04049 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAF1P04049 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAF1P04049 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
RAF1P04049 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAF1P04049 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
RAF1P04049 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAF1P04049 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
RAF1P04049 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
RAF1P04049 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
RAF1P04049 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
RAF1P04049 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAF1P04049 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
RAF1P04049 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAF1P04049 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAF1P04049 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAF1P04049 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAF1P04049 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
RAF1P04049 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAF1P04049 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAF1P04049 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
RAF1P04049 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
RAF1P04049 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAF1P04049 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAF1P04049 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
RAF1P04049 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAF1P04049 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAF1P04049 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAF1P04049 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
RAF1P04049 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
RAF1P04049 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAF1P04049 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAF1P04049 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAF1P04049 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAF1P04049 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAF1P04049 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAF1P04049 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
RAF1P04049 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAF1P04049 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAF1P04049 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
RAF1P04049 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAF1P04049 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
RAF1P04049 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
RAF1P04049 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAF1P04049 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAF1P04049 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
RAF1P04049 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAF1P04049 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAF1P04049 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAF1P04049 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAF1P04049 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAF1P04049 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAF1P04049 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
RAF1P04049 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAF1P04049 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
RAF1P04049 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
RAF1P04049 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
RAF1P04049 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
RAF1P04049 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAF1P04049 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAF1P04049 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAF1P04049 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
RAF1P04049 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
RAF1P04049 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAF1P04049 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAF1P04049 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAF1P04049 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAF1P04049 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
RAF1P04049 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
RAF1P04049 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAF1P04049 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
RAF1P04049 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAF1P04049 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAF1P04049 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAF1P04049 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RAF1P04049 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms